梅EST-SSR标记的开发及利用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 上官凌飞

作者： 上官凌飞;李晓颖;宋长年;王西成;王玉柱;章镇;房经贵

作者机构：

关键词： 梅;杏;EST-SSR;遗传差异分析

期刊名称： 西北植物学报

ISSN： 1000-4025

年卷期： 2010 年 30 卷 09 期

页码： 1766-1772

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用MISA软件对10 123条梅EST序列进行SSR位点查找,得到含SSR位点的序列935条,SSR位点1 233个,平均每100条EST序列中含有12.18个SSR位点。2核苷酸、3核苷酸重复是最主要的重复类型,分别占35.52%和41.36%。设计了40对EST-SSR引物并进行扩增,有24对引物能扩增出理想的PCR产物,其中17对引物具有较好的扩增多态性。测序后发现13对引物中有73.08%的片段具有相应的SSR位点,对杏DNA指纹中部分谱带的测序结果也证明了是梅扩增出的相应的SSR位点。根据本研究含有SSR位点的测序结果推算,从梅EST中开发真实SSR位点的数目为901。随机选择13对引物对杏和梅进行DNA指纹构建与遗传多样性分析,结果发现,来源于梅的EST-SSR引物在杏中有很高的通用性,这些引物把梅和杏分成了两大群体,说明他们是遗传差异明显的两种植物。

分类号： S662.4

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