鸡mir-1644基因“seed”区的T>C多态分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 耿立英

作者： 耿立英;张传生;尹春光;曹顶国;杜立新;陈娟

作者机构：

关键词： 鸡;mir-1644;seed;单核苷酸多态

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2011 年 44 卷 13 期

页码： 2808-2813

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】观察"seed"区T>C多态对鸡mir-1644基因"茎环"结构和靶基因选择的影响,分析其在不同鸡群的遗传分布,为揭示其对mir-1644表达调控的影响及表型效应奠定基础。【方法】利用mfold和miRanda软件进行mir-1644二级结构模拟和靶基因预测,采用引入酶切位点RFLP技术对6个鸡群的179个个体进行基因型检测。【结果】①T→C突变可导致pre-mir-1644空间构型和自由能改变,稳定性降低;②预测到21个mir-1644-T和mir-1644-C基因差异调控的靶基因。③在汶上芦花鸡群体内以C等位基因为优势基因,与其它鸡间的基因型分布存在显著差异(P<0.01)。【结论】"seed"区T>C突变可能干扰或破坏mir-1644基因的表达调控,且CC基因型可能与汶上芦花鸡某些表型变异有关。

分类号： S831

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