花魔芋NBS-LRR类抗病基因同源序列的分离及分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 魏环宇
作者: 魏环宇;魏薇;杨敏;裴卫华;赵建荣;钟宇;刘佳妮;陈泽斌;陈海如;余磊
作者机构:
关键词: 魔芋;NBS-LRR;抗病基因同源序列
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2019 年 23 期
页码: 7721-7726
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 分离和分析花魔芋的抗病基因同源序列(resistance gene analogs, RGAs),为魔芋抗病相关基因的克隆和分析提供了机遇。本研究利用生物信息学手段,参考已知植物抗病基因的NBS-LRR类保守结构域筛选并合成了4对简并引物,从花魔芋的基因组DNA中扩增出4条NBS-LRR类抗病基因同源序列。序列分析表明,这4条RGAs序列均不同程度地含有NBS保守域的典型特征。Blast X分析发现,获得的4条魔芋RGAs与已知植物RGAs的氨基酸序列相似性为55%~76%。同源进化分析表明,这些魔芋RGAs均属于non-TIR-NBS-LRR类且可以分成3个亚类。本研究通过分子克隆技术获得花魔芋的抗病基因同源序列,为利用同源克隆技术克隆魔芋抗病基因作出探讨,为培育抗病新品种及抗病转基因育种提供参考。
分类号: S436.32
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