紫苏EST-SSR分布特征及标记开发

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张天缘

作者： 张天缘;宋莉;沈奇

作者机构：

关键词： 紫苏;EST-SSR;分子特征;标记开发

期刊名称： 贵州农业科学

ISSN： 1001-3601

年卷期： 2017 年 45 卷 09 期

页码： 114-118

摘要： 为了解紫苏属植物的遗传多样性,为种质资源的开发利用提供依据,利用软件MISA对从NCBI上获取的5 435条EST序列进行紫苏SSR分析。结果表明:在1 206条EST序列中得到符合条件的SSR为22.19%;共检出1 526个SSR位点,平均覆盖深度为28.87%;EST-SSR有32种重复基元,以二核苷酸重复基元AG/CT最多,占检出总SSR的34.73%;包含低级基元单核苷酸重复、二核苷酸重复和三核苷酸重复,其长度在20bp以上的EST-SSR有386条。最终设计获得包含单核苷酸重复、二核苷酸重复和三核苷酸重复低级基元的SSR引物723条。

分类号： S567.219

  • 相关文献

[1]棉花EST-SSR新标记特征及其遗传多样性分析. 梁维维,张大伟,陈全家,曲延英,高文伟. 2013

[2]药用植物苦参EST-SSR标记的开发及DNA指纹图谱的构建. 段永红,雷海英,张旭,吴玉香,孙毅. 2018

[3]白花草木樨EST-SSR标记的开发与筛选. 剡转转,任艳,吴凡,骆凯,张代玉,闫启,张宇飞,赵玉凤,张吉宇. 2017

[4]南瓜属EST-SSR标记的开发及在杂种纯度鉴定中的应用. 张国裕,张帆,姜立纲,翟伟卜,李海真. 2011

[5]圭亚那柱花草新EST-SSR标记验证及其在柱花草属上的转移. 丁西朋,罗小燕,贾庆麟,白昌军. 2015

[6]大白菜EST-SSR标记开发中非SSR标记的鉴别. 周新成,刘立峰,李化银,高建伟. 2010

[7]川芎转录组SSR分析与EST-SSR标记的开发. 彭芳,杨泽茂,钟文娟,牟方生,龚一耘,戢沛城,蒲德强,黄海燕,杨晓,张超. 2017

[8]草莓EST-SSR标记的开发与应用. 王静,赵密珍,于红梅,王壮伟. 2011

[9]栽培种花生EST-SSR引物的开发及应用. 肖洋,廖伯寿,晏立英,黄家权,任小平,雷永,姜慧芳. 2010

[10]甘蓝EST-SSR标记的开发与应用. 陈琛,庄木,李康宁,刘玉梅,杨丽梅,张扬勇,程斐,孙培田,方智远. 2010

[11]辣椒EST-SSRs分布特征及其应用. 支莉,王述彬,刁卫平,刘金兵,潘宝贵,戈伟,于彩云. 2010

[12]辣椒EST-SSR标记的开发与验证. 李永平,林珲,康建坂,温庆放. 2016

[13]海蓬子属植物EST序列的SSR信息分析与标记开发. 黄益洪,张强,张大勇,徐照龙,许玲,刘晓庆,何晓兰,马鸿翔. 2013

[14]玉米分子标记辅助育种及标记开发研究进展. 陈秀华,于丽娟,罗黎明,陈洪梅,刘丽. 2016

[15]马铃薯块茎形状CAPS标记的开发与验证. 朱文文,徐建飞,李广存,段绍光,刘杰,卞春松,庞万福,WalterDeJong,金黎平. 2015

[16]木薯块根肉质颜色基因CAPS标记的开发与验证. 周慧文,严华兵,肖亮,陈新. 2018

[17]基于菊芋转录组的SSR分子标记开发及鉴定. 杨世鹏,孙雪梅,王丽慧,高洁铭,李莉,田洁,赵孟良,钟启文. 2018

[18]大菱鲆(Scophthalmus maximus)微卫星序列的开发与分析. 李猛,马爱军,岳亮,邹杰,王广宁,田岳强,马本贺,夏丹丹. 2013

[19]四倍体马铃薯熟性连锁SCAR标记的开发与验证. 李兴翠,李广存,徐建飞,段绍光,卞春松,庞万福,刘杰,金黎平. 2017

[20]偃麦草属分子标记开发研究进展. 朱艳,畅志坚,张晓军,李欣,詹海仙,郭慧娟,乔麟轶. 2017

作者其他论文 更多>>

微信小程序