川乡黑猪重要经济性状SNP位点分型及分子系谱构建

文献类型: 中文期刊

第一作者: 杨坤

作者: 杨坤;安瑞;杨雪梅;顾以韧;陈晓晖;吕学斌

作者机构:

关键词: 川乡黑猪;经济性状;SNP;分子系谱

期刊名称: 中国畜牧杂志

ISSN: 0258-7033

年卷期: 2024 年 006 期

页码: 133-137

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究旨在分析川乡黑猪重要经济性状因果突变和紧密关联SNP位点基因型分布情况,构建川乡黑猪分子系谱。利用全基因组SNP芯片技术对样本进行扫描分析,通过主成分分析、计算遗传距离、ROH分析等对公猪亲缘关系和血统进行划分,解析川乡黑猪的群体结构和遗传多样性。结果显示:川乡黑猪群体中采食量、氟烷(Hal)基因和酸肉基因2(RN2)已完全剔除非优势基因q;体长基因无QQ基因型和Qq杂合基因型,qq非优势基因型频率达100%;抗仔猪腹泻和多胸椎数基因Qq、qq基因型总比例分别为18.07%和26.10%,其中qq基因型比例为3.21%和2.01%;公猪精液品质和酸肉基因1(RN1)的Qq、qq基因型总比例较高,分别为45.78%和34.54%,并且Qq基因型比例均超过30%;多肋骨数和耗料增重比基因中优势基因型QQ比例只有18.47%和47.79%,低于50%。公猪群体主成分分析和聚类分析结果显示,该群体可被划分为16个不同的家系。以上结果表明,川乡黑猪的选育可着重于提高抗仔猪腹泻、多胸椎数、多肋骨数、公猪精液品质、酸肉和耗料增重比等基因的优势基因型频率,并结合亲缘关系和家系划分结果,通过分子标记辅助选择技术进一步优化种群结构。

分类号: S828

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