基于叶绿体DNA信息的南方梨属种质的遗传多样性和演化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 齐丹

作者： 齐丹;常耀军;曹玉芬;胡红菊;田路明;董星光;张莹;霍宏亮;徐家玉;张小双;刘超

作者机构：

关键词： 梨;种质;叶绿体DNA;遗传多样性;演化分析

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2018 年 12 期

页码： 2308-2320

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 选取5个叶绿体DNA非编码区trn L-trn F-1、trn L-trn F-2、trn S-psb C、acc D-psa I、rps16-trn Q和1个基因区域rbc L,对中国秦岭淮河以南地区的梨(Pyrus L.)资源进行遗传多样性和演化分析。将188份梨资源的测序结果整合得到长度为5 612 bp(包含缺失片段),共检测出13个单倍型、4个单一突变位点、16个简约性信息位点和14个插入/缺失片段(InDels),单倍型多样性H_d为0.7178,核苷酸多样性为0.35×10~(-3)。acc D-psa I区域的分析结果显示该区域的H_d值最高,为0.7177;rbc L区域的H_d值最低,为0.0317。其中162份梨资源检测出12个单倍型,H_d为0.713,核苷酸多样性为0.29×10~(-3);梨的不同地理群体中湖南省的10个梨地方品种的H_d最高,为0.889;来自贵州省的8个品种的H_d最低,为0。138份砂梨地方品种共检测出8个叶绿体单倍型,其中单倍型H2、H4和H5在130份砂梨和37份白梨品种中检测到,单倍型H6、H10、H11、H12和H13在8份砂梨地方品种‘青皮钟’、‘甜宵梨’、‘细花红梨’、‘惠阳红梨’、‘麝香梨’、‘塘湖青’、‘红粉’和‘横县浸泡梨’中检测到。Median-joiningNetwork图显示单倍型H6和H11为古老单倍型,H1、H4和H5为较进化的单倍型。根据叶绿体DNA序列变异信息可推测秦岭淮河以南地区的砂梨和白梨亲缘关系较近,同时来自湖南地区的砂梨种质资源具有丰富的遗传多样性。

分类号： S661.2

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