文献类型： 中文期刊
第一作者： 葛李爽
作者： 葛李爽;冯娟娟;张梦;郭立平;戚廷香;张学贤;李永旗;唐会妮;乔秀琴;邢朝柱;吴建勇
作者机构：
关键词： 棉花;细胞质雄性不育;线粒体基因组;孢子体不育;配子体不育;开放阅读框
期刊名称： 棉花学报
ISSN： 1002-7807
年卷期： 2024 年 001 期
页码： 28-38
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 【目的】探究哈克尼西棉不育胞质（CMS-D2）和三裂棉不育胞质（CMS-D8）的不育系线粒体基因组之间的序列结构差异，为筛选鉴定不育相关基因奠定基础。【方法】根据D2A和D8A这2个不育系的线粒体基因组测序组装结果，使用Synteny and Rearrangement Identifier（Sy RI）软件鉴定结构变异，用Plotsr可视化分析包含共线性及非共线性区域的重组变异位点。以D8A线粒体基因组注释结果为参考，用D2A线粒体基因组注释的开放阅读框（open reading frame, ORF）编码的氨基酸序列进行tblastn比对，筛选出D2A线粒体基因组中特有的ORF，并进行聚合酶链式反应（polymerase chain reaction, PCR）验证、相对表达量分析和生物信息学分析。【结果】D2A和D8A这2个不育系线粒体基因组之间存在2个部分重叠且相邻的倒易位区域。在D2A中发现17个特异的ORF,PCR验证了D2A中存在的6个特异ORF（orf114e、orf121b-1、orf121b-2、orf138b-2、orf186a-2和orf317a-2）。3～4 mm花蕾中orf121b-1和orf121b-2的相对表达量较高。orf114e、orf186a-2和orf317a-2具有典型的跨膜结构域和嵌合基因结构，符合不育基因的部分特征。【结论】D2A和D8A线粒体基因组间存在2个相邻的倒易位区域。D2A中存在6个特异的ORF，其中orf114e、orf186a-2和orf317a-2可能与棉花CMS-D2孢子体败育有关。
分类号： S562
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