滇牡丹PdANR基因克隆及表达模式分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 杜春
作者: 杜春;平怀磊;王文治;张平芳;张怀壁;王娟
作者机构:
关键词: 滇牡丹;PdANR;基因克隆;表达分析
期刊名称: 北方园艺
ISSN: 1001-0009
年卷期: 2022 年 024 期
页码: 42-52
收录情况: 北大核心
摘要: 以不同时期不同花色的滇牡丹花瓣为试材,采用RT-PCR技术克隆得到PdANR基因的全长cDNA序列,并利用生物信息学预测PdANR蛋白的结构特征及理化性质,结合实时荧光定量PCR(qPCR)分析PdANR基因在各色组织间的表达模式,以期为滇牡丹原花青素的相关研究提供参考依据。结果表明:PdANR基因含有一个1 011 bp的完整开放阅读框(OFR),编码336个氨基酸残基,蛋白分子量为36.46×10~3 g·mol-1,等电点为8.82,半衰期为30 h,不稳定指数为29.56,疏水指数为0.071,推测其为疏水性的稳定蛋白。同时,亚细胞预测显示该蛋白在细胞外中的分值最高。系统进化树表明,ANR蛋白具有明显的种属特性,其中PdANR蛋白与其它科植物的亲缘关系都较远。qPCR结果表明PdANR基因在花瓣、萼片及花药中均有表达,花瓣中的表达量会随着组织的发育而显著减少。
分类号: S685.11
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