基于BSA-seq技术对西瓜抗枯萎病生理小种1的基因定位

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李超汉

作者： 李超汉;朱丽华;尤佳琪;杨红娟;李青竹;宋荣浩;顾卫红

作者机构：

关键词： 西瓜;枯萎病;抗枯萎病基因;基因定位;SNP指数;InDel指数

期刊名称： 上海农业学报

ISSN： 1000-3924

年卷期： 2024 年 002 期

页码： 11-19

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 西瓜枯萎病是由尖孢镰刀菌西瓜专化型（Fusarium oxysporumf. sp.niveum）引起的土传真菌病害,是西瓜生产的限制因子。本研究以西瓜抗病种质“V13-9-3”和感病种质“W16-1”为亲本,构建了“W16-1”דV13-9-3”的F1、F2群体。苗期人工接种结果显示:F1植株表现抗病,F2群体的抗病∶感病分离比为3∶1,表明西瓜枯萎病生理小种1的抗性遗传受显性单基因控制。利用BSA技术,采用SNP指数和In Del指数法,将西瓜抗枯萎病基因Fon-1定位在1号染色体上2.20 Mb和2.32 Mb区域内,将这2种方法的定位结果取交集,最终将目标抗病基因区域缩小在2.20 Mb之内,该区域包含8个非同义突变基因和1个移码突变基因。利用荧光定量PCR检测这9个突变基因在接种枯萎病菌5 d和10 d后的表达量变化,发现抗病亲本“V13-9-3”中有7个基因的表达量显著高于感病亲本“W16-1”。研究通过结合SNP指数和In Del指数分析可以快速进行基因初定位,为西瓜抗枯萎病的分子机理研究提供理论依据。

分类号： S436.5

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