一株Asia 1型口蹄疫病毒的全基因组序列测定及比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李爽

作者： 李爽;李勐;高明春;于力;周国辉;王君伟

作者机构：

关键词： 口蹄疫病毒;基因组;序列分析

期刊名称： 中国预防兽医学报

ISSN： 1008-0589

年卷期： 2008 年 30 卷 03 期

页码： 205-211

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 参考GenBank上已发表的口蹄疫病毒(FMDV)全长基因组序列,设计了覆盖基因组全长的数对引物,通过RT-PCR方法对1株Asia 1型(简称As01)FMDV进行分段克隆及序列测定,将测序结果利用软件进行拼接。结果表明,该毒株的FMDV基因组[不含poly(C)]全长8 180 nt,其中编码区为6 987 nt,5'和3'非编码区(UTR)分别为1 078 nt和95 nt,3'UTR之后为20 nt的poly(A)尾巴。将As01株与其他FMDV参考毒株利用分子生物学软件进行多序列比对分析表明,As01株与Asia 1/Jiangsu/China/2005、Asia 1/Isrl/3/63、ZB/CHA/58等Asia 1型FMDV遗传进化关系较为密切,而与O型和A型FMDV遗传关系较远。

分类号： S852.65

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