中国盖塔病毒Ⅲ型变异株的全基因组序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 许浒

作者： 许浒;冯子萱;龚帮俊;张思钰;李超;李金昊;郭镇洋;张雪莉;石佳豪;宋紫雨;彭金美;王倩;周国辉;汤艳东;安同庆;蔡雪辉;冷超粮;张洪亮;田志军

作者机构：

关键词： 盖塔病毒;Ⅲ型变异株;分子特征

期刊名称： 中国预防兽医学报

ISSN： 1008-0589

年卷期： 2025 年 47 卷 003 期

页码： 303-307

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 盖塔病毒（GETV）是一种广泛分布于亚洲和泛太平洋国家的蚊媒RNA病毒，其感染宿主众多，对猪致病力强。2024年7月至8月，河南省和湖北省的8个规模化养猪场2个月内集中出现哺乳仔猪发烧、腹泻和死亡等临床症状，仔猪发病率约为10%20%，死亡率高达100%。为探究疾病暴发的原因，本研究在8个猪场分别采集猪肺脏、脾脏、肠道组织，每个猪场合为1个样品，共8份临床样品。采用RT-qPCR和qPCR方法鉴定各疑似病原，结果显示8份样品中非洲猪瘟病毒（ASFV）、猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）、猪瘟病毒（CSFV）、猪圆环病毒2型（PCV2）、PCV3和猪伪狂犬病毒（PRV）均为阴性。进一步利用RT-PCR在8份样品中扩增出GETV的Nsp3和E2基因，8份样品均为GETV阳性，确定本次疫情由GETV引起。测序获得8份样品的Nsp3和E2基因序列，选取其中1株（HN1）分8段扩增各基因序列，利用SeqMan拼接获得HN1株全基因组序列。参照GenBank中Group Ⅰ-Group Ⅳ型GETV代表株的E2基因、Nsp3基因和全基因组序列，利用Megalign软件分析本研究鉴定的GETV与各型GETV代表株E2序列的相似性；利用MEGA7.0构建上述GETV E2基因和全基因组序列（HN1株）的遗传进化树，分析其遗传变异情况；利用Megalign软件分析各型GETV Nsp3氨基酸突变特征。E2基因编码氨基酸序列相似性比对结果显示，本研究鉴定的各株GETV之间E2氨基酸序列的相似性均达100%，同时与Group Ⅲ型代表株GETVV1株E2基因序列的相似性较高（98.5%98.6%）。基于E2基因和全基因组序列构建的进化树结果显示，本研究鉴定的GETV均属于Group Ⅲ型（Ⅲ型），形成了一个独立分支，将其命名为GETV III型变异株。Nsp3氨基酸序列比对分析发现，GETV III型变异株与其他GETV相比在S329、T/I381和G503处存在3个特征性氨基酸突变，可以作为鉴别GETV Ⅲ型变异株的分子特征，且特征性氨基酸突变均位于Nsp3的高变结构域（HVD）内，可能与GETV Ⅲ型变异株毒力增强有关。本研究首次鉴定了GETV Ⅲ型变异株，并首次报道GETV Ⅲ型变异株在我国河南省和湖北省引起疫病的集中暴发，对了解我国GETV流行现状以及对其感染的防控均具有重要的指导意义。

分类号： S852.651

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