山药种质资源核糖体rDNA-ITS区序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴志刚

作者： 吴志刚;范传颍;包晓青;陶正明;姜武

作者机构：

关键词： 山药;ITS;亲缘关系;系统进化;分子鉴定

期刊名称： 中草药

ISSN： 0253-2670

年卷期： 2014 年 45 卷 08 期

页码： 1136-1142

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 目的分析14种山药Dioscoreae Rhizoma种质ITS序列,为山药种质资源分子鉴别和进化关系研究提供依据。方法 PCR克隆扩增ITS序列并进行双向测序,Clustal X(v1.83)软件进行序列比对,Mega(V4.1)计算序列核苷酸比例及遗传距离,并构建邻接树(Neighbor-joining,NJ)和最大简约树(Maximum parsimony,MP)。结果 14种山药种质ITS序列全长为558~594 bp,其中ITS1长度为141~165 bp,ITS2长度为146~158 bp;ITS序列存在大量的转换、颠换,转化/颠换比率为5.347,ITS1和ITS2序列均显示102个变异位点;14种山药种质K2-P遗传距离为0~0.517 2;薯蓣Dioscorea opposita、褐苞薯蓣Dioscorea persimilis、日本薯蓣Dioscore japonica关系亲密,组成单一支系;参薯Dioscorea alata与山薯Dioscorea fordii关系亲密,聚为另一分支,并位于发育树基部。结论 ITS序列系统树为澄清山药类资源进化关系奠定了基础,序列中丰富的变异位点为多基原山药鉴别提供了科学依据。

分类号： S632.1

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