柑橘碎叶病毒外壳蛋白基因的克隆和序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 宋震

作者： 宋震;刘科宏;杨方云;唐科志;李中安;周常勇

作者机构：

关键词： 柑橘碎叶病毒;CTLV;外壳蛋白基因;克隆;序列分析

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2009 年 42 卷 10 期

页码： 3741-3748

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】了解中国CTLV分离物外壳蛋白(CP)基因的变异情况。【方法】对来源于中国不同地区、不同寄主品种的18个柑橘碎叶病毒(CTLV)分离物进行RT-PCR、克隆、测序,应用DNAMAN软件进行序列分析。【结果】18个分离物的CP基因全长714nt,推导的CP含237个氨基酸。CP核苷酸序列及推导的氨基酸序列最大相似性分别为88.5%～99.9%和91.1%～99.6%。与核苷酸序列G289→A或C、A409→C和G414→T的单碱基突变相对应,CTLV外壳蛋白第97、137、138位氨基酸在强、弱毒分离物之间存在差异,多数弱毒分离物为Q97或K97、Q137、H138,而多数强毒分离物为E97、R137或K137、Q138。在根据CP氨基酸序列构建的系统进化树上,本研究获得的18个CTLV分离物至少可以划分为2个组群,其中,在指示植物上表现较弱症状的多数(4/6)CTLV分离物划分在第Ⅰ组群,多数(10/12)CTLV强毒分离物划分在第Ⅱ组群。【结论】CTLV外壳蛋白基因相对保守,其第289、409、414位碱基在强、弱毒分离物之间存在差异,可能与病毒致病性相关。

分类号： S436.66

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