欧洲葡萄VvCAX基因家族的鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 崔小月

作者： 崔小月;尚泓泉;吕中伟;娄玉穗;张柯

作者机构：

关键词： 欧洲葡萄;VvCAX基因家族;基因结构;胁迫响应;表达分析

期刊名称： 河南农业科学

ISSN： 1004-3268

年卷期： 2023 年 52 卷 011 期

页码： 113-123

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： CAX(Ca2+/H+ exchanger antiporter)是一类重要的阳离子转运蛋白,在植物生长发育和抵抗非生物胁迫中至关重要.通过生物信息学分析的方法,从欧洲葡萄中共鉴定出5个VvCAX基因,根据其在染色体上的位置依次命名为VvCAX1—VvCAX5,进行了包括理化性质、二级结构、三级结构、跨膜结构域、基因结构、保守基序、系统进化树等分析.结果表明,VvCAX基因家族成员均为疏水蛋白,主要定位于质膜和液泡,包含10~11个跨膜结构域和4个典型的功能域,α-螺旋和无规则卷曲在二级结构中占据主要位置,所有成员三级结构非常相似且均为单体.系统发育分析将VvCAX分为2个亚家族,同一亚家族的VvCAX结构相似,不同亚家族VvCAX的保守基序有差异,且7对VvCAX基因在进化过程中发生了基因的片段复制事件.VvCAX的互作蛋白主要与钙离子转运、钙离子通道和离子转运相关.上游调控因子和启动子顺式作用元件分析结果表明,VvCAX基因可能通过MYB、ERF等转录因子的调控参与激素和胁迫响应,这一推论经表达模式分析得到了验证.通过不同胁迫下的表达分析发现,所有VvCAX基因的表达水平均受ABA的影响,ⅠA亚家族的成员响应创伤、霜霉菌、干旱和低温,而ⅠB亚家族的成员主要与高温有关,ⅠA亚家族的VvCAX基因更有研究价值.

分类号： S663.1

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