基于复合EST-SSR标记的大白菜种子纯度鉴定及SNP位点获取

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵新

作者： 赵新;王永;兰青阔;贺长征;陈锐;李欧静;刘娜;朱珠;郭永泽

作者机构：

关键词： 大白菜;种子;纯度鉴定;复合EST-SSR;SNP

期刊名称： 中国蔬菜

ISSN： 1000-6346

年卷期： 2013 年 1 卷 14 期

页码： 31-38

收录情况： 北大核心

摘要： 以10份大白菜杂交种及其亲本为研究对象,基于NCBI基因组数据库中EST序列信息,应用SSR标记及高分辨率溶解曲线技术筛选出用于大白菜杂交种纯度鉴定的SNP位点及复合SSR位点,并根据高通量分子检测技术种子纯度鉴定的需要,对单粒种子育苗条件、单株植株提取状态、快速DNA提取方法、复合PCR体系的建立等关键技术进行了摸索及优化。结果显示:经过48h破壳状态的单粒种子,采用改良CTAB法可于3h内得到较高质量的DNA;同时经7d达到苗期状态的单株叶片,采用chexe-100法亦可于40min内完成DNA提取;筛选得到的SNP位点可对6份大白菜杂交种进行纯度鉴定,复合SSR位点可对10份大白菜杂交种进行纯度鉴定。

分类号： S634.1

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