马铃薯SBP转录因子家族的全基因组鉴定及进化和表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郭存

作者： 郭存;李晓旭;刘成;李奎;郭永峰

作者机构：

关键词： SBP转录因子家族;马铃薯;拟南芥;生物信息学

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 16 卷 20 期

页码： 6557-6565

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： SBP转录因子家族是植物特有的一类转录因子家族,主要参与植物生长、发育和多种生理生化过程的信号传导。马铃薯是一种重要的经济和粮食作物,但马铃薯SBP转录因子家族的分析尚未见报道。本研究利用生物信息学技术,对马铃薯基因组进行分析,在马铃薯中共鉴定出16个SBP转录因子,并对其系统进化关系、编码基因结构以及基因表达模式进行研究。系统进化分析表明,马铃薯和拟南芥SBP转录因子家族成员共31个成员,被分成7个亚家族(Subgroup);结构分析表明,同一亚家族内的成员的蛋白保守结构域的类别、组成以及编码基因的基因结构具有高度的相似性,但不同亚家族的成员差异较大;基因表达分析表明,编码SBP转录因子家族成员的基因表达模式具有明显的时空特异性,且成员对不同的激素处理有不同的响应模式。本研究为进一步研究马铃薯SBP转录因子的功能以及可能的调控机制研究提供了理论依据。

分类号： S532`Q943.2

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