HIGD2A基因在不同海拔藏猪肺组织的表达特点及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王茂

作者： 王茂;罗淦;薛云;呷西彭错;梁艳;康润敏;刘鹏亮;崔日成;余石佳;顾以韧

作者机构：

关键词： 藏猪;肺组织;低氧适应;HIGD2A基因;生物信息学分析

期刊名称： 中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2025 年 61 卷 008 期

页码： 249-254

收录情况： 北大核心

摘要： 藏猪作为我国重点保护的高原型猪种，在长期的繁衍和进化过程中形成了适应高原低氧环境的能力，并成为研究高原低氧适应机制的模式动物。缺氧诱导结构域家族成员2A(Hypoxia Inducible Domain Family Member 2A,HIGD2A)蛋白可调节线粒体呼吸链复合物的组装，进一步影响细胞有氧能量代谢。本研究以不同海拔藏猪肺组织为试验材料，分析了HIGD2A基因在不同海拔藏猪肺组织中的表达情况，利用在线生物信息学工具解析了HIGD2A基因的启动子特征，以及与HIGD2A基因潜在作用的miRNA。结果表明，HIGD2A基因在低海拔地区（500 m）的表达水平高于高海拔地区（3100 m和3850 m,P<0.01）；通过在线生物信息学网站进一步分析发现，HIGD2A基因启动子上游1 489～1 760 bp和1 764～1 944 bp处存在2个CpG岛，转录因子Spi1/PU.1和SP1在该区域存在结合位点。使用Startbase和TargetScan数据库共筛选到21个与HIGD2A基因3'UTR潜在结合的miRNA，其中ssc-miR-140-5p、ssc-miR-181a和ssc-miR-181b的结合能分别为-19.1、-20.2 kcal/mol和-22.1 kcal/mol。此外，ssc-miR-140-5p与HIGD2A基因在不同海拔藏猪肺组织中存在相反的表达模式。本研究为藏猪适应高原低氧环境作用机制研究提供了理论依据。

分类号： S828

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