利用转录组测序筛选鸡繁殖性状相关lncRNAs
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李春苗
作者: 李春苗;贾雪波;黄正洋;黎寿丰;黄华云;王钱保;薛龙岗;赵振华
作者机构: 江苏省家禽科学研究所;中国农业科学院家禽研究所
关键词: 转录组;鸡;垂体;lncRNA
期刊名称: 中国家禽
ISSN: 1004-6364
年卷期: 2021 年 43 卷 012 期
页码: 7-13
收录情况: 北大核心
摘要: 为探讨长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)在鸡繁殖性状中的作用,研究通过分析苏禽3号高产组和低产组母鸡垂体转录组数据,结合edgeR软件预测出在鸡垂体中差异表达的lncRNA,并通过GO和KEGG pathway富集分析,找出与鸡繁殖性状相关的差异表达lncRNA.结果 表明,通过预测得到952个差异表达的lncRNA,其中908个上调,44个下调;差异表达的lncRNA共富集到9个信号通路,与繁殖性状相关的通路分别为BMP和cAMP,共筛选到3个与繁殖性状相关的lncRNA,推测这3个lncRNA在鸡繁殖过程中起重要作用,但其机制还需要进一步研究.研究结果对进一步深入研究与鸡产蛋性能相关的lncRNA生物学功能及调控机制奠定了基础,丰富了鸡的生殖调控理论.
分类号: S831.2
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