陆地棉耐碱基因GHZAT12的克隆、表达及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 范亚朋

作者： 范亚朋;范亚朋;芮存;张悦新;陈修贵;陆许可;王帅;张红;徐楠;王晶;陈超;叶武威

作者机构：

关键词： GhZAT12;棉花;生物信息学分析;亚细胞定位;qRT-PCR;碱胁迫

期刊名称： 生物技术通报

ISSN：

年卷期： 2021 年 008 期

页码： 121-130

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 一些锌指蛋白转录因子家族成员在调节植物生长、发育和非生物胁迫中发挥重要作用。本研究旨在了解棉花C2H2转录因子家族中的成员GhZAT12在应对抵御逆境胁迫方面的作用。生物信息学分析结果显示,GhZAT12基因的编码区序列全长为474 bp,编码157个氨基酸,蛋白质分子量为17.074 kD。GhZAT12蛋白不含跨膜结构域,是一种非分泌型亲水蛋白,有7个磷酸化位点,没有信号肽。GhZAT12包含两个C2H2型锌指结构域,在其N端含有保守的L-box,C末端含有一个EAR-Motif。系统发育树分析表明GhZAT12与可可（XP017982131.1）中的锌指蛋白亲缘关系较近。从棉花中克隆获得GhZAT12基因CDS序列,并构建了亚细胞定位载体,利用烟草瞬时表达系统对GhZAT12-GFP融合蛋白进行了亚细胞定位,结果表明,GhZAT12蛋白定位于细胞核中。qRT-PCR分析结果表明,陆地棉中GhZAT12的相对表达量在根中最高,其次是叶,在茎中表达量最低。碱胁迫处理后不同时间内,GhZAT12基因的表达量先升高后下降,推测GhZAT12基因可能在碱胁迫中发挥着重要的作用。

分类号： S562

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