基于SSR和InDel标记的海南荔枝种质资源遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李焕苓

作者： 李焕苓;田婉莹;孙进华;张新春;张蕾;王果;王树军;王家保

作者机构：

关键词： 荔枝;SSR;InDel;遗传多样性

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 04 期

页码： 1343-1356

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解232份主要来自海南的栽培荔枝、半野生荔枝和野生荔枝的遗传多样性及其演化地位,摸清荔枝品种中存在的同名异物和同物异名问题;本研究依据获得的荔枝EST序列和基因组序列开发了一批SSR和InDel标记,利用这些标记对232份荔枝种质资源进行了遗传多样性研究;取6个荔枝品种DNA为模板,筛选出18对SSR引物和12对InDel引物应用于遗传多样性研究,检测到基因位点141个,等位基因变异数范围为2~11个,平均4.70个,多态性位点为139个,多态性位点比率是98.58%。UPGMA聚类分析发现,232份荔枝种质资源的遗传相似系数是0.66~1.00;发现SSR引物的多态性大于InDel引物;在遗传相似系数为0.76处,供试材料分为15类,多数来自海南的荔枝资源能一起聚类,海南11份野生荔枝资源分别聚类在5个类群中,说明海南野生荔枝资源的遗传多样性较丰富。研究将为进一步开展荔枝遗传改良和育种提供依据。

分类号： S667.1

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