基于SSR和InDel标记的海南荔枝种质资源遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李焕苓

作者： 李焕苓;田婉莹;孙进华;张新春;张蕾;王果;王树军;王家保

作者机构：

关键词： 荔枝;SSR;InDel;遗传多样性

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 04 期

页码： 1343-1356

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解232份主要来自海南的栽培荔枝、半野生荔枝和野生荔枝的遗传多样性及其演化地位,摸清荔枝品种中存在的同名异物和同物异名问题;本研究依据获得的荔枝EST序列和基因组序列开发了一批SSR和InDel标记,利用这些标记对232份荔枝种质资源进行了遗传多样性研究;取6个荔枝品种DNA为模板,筛选出18对SSR引物和12对InDel引物应用于遗传多样性研究,检测到基因位点141个,等位基因变异数范围为2~11个,平均4.70个,多态性位点为139个,多态性位点比率是98.58%。UPGMA聚类分析发现,232份荔枝种质资源的遗传相似系数是0.66~1.00;发现SSR引物的多态性大于InDel引物;在遗传相似系数为0.76处,供试材料分为15类,多数来自海南的荔枝资源能一起聚类,海南11份野生荔枝资源分别聚类在5个类群中,说明海南野生荔枝资源的遗传多样性较丰富。研究将为进一步开展荔枝遗传改良和育种提供依据。

分类号： S667.1

  • 相关文献

[1]基于SSR、InDel分子标记的红甜菜遗传多样性分析. 刘蕊,刘乃新,吴玉梅,吴则东,兴旺,王秋红. 2019

[2]禾荔特晚熟焦核突变体GLL-1全基因组变异分析. 丁峰,李浩然,王金英,彭宏祥,何新华,黄小雄,李平,钟敏芝,覃燕,张树伟. 2021

[3]利用SSR和InDel标记构建白菜×芜菁分子遗传图谱. 赵湘,于拴仓,薛林宝,张凤兰,赵凡,余阳俊,赵岫云,张德双,汪维红. 2011

[4]8个水稻抗条纹叶枯病分子标记有效性的验证及评价. 张亚东,朱镇,陈涛,赵庆勇,周丽慧,于新,王才林. 2012

[5]采用InDel和SSR标记分析番茄品种基因组DNA多态性. 申璐,沈火林,柴敏,王银磊,杨文才. 2011

[6]基于转录组测序的椰心叶甲啮小蜂SSR、SNP和InDel位点分析. 刘华伟,李朝绪,李芬,吕朝军,吴少英,覃伟权. 2021

[7]大白菜自交系背景选择InDel标记与重要农艺性状的关联分析. 赵玉靖,卢银,冯大领,罗蕾,吴芳,杨锐,陈悦琦,孙晓雪,王彦华,陈雪平,申书兴,罗双霞,赵建军. 2021

[8]基于核心InDel标记樱桃番茄种质资源的遗传多样性分析与应用. 张辉,李鑫,王志敏,胡俊玲,鲁晓晓,潘峰,潘春阳,苏文悦,徐毛毛,张敏,高浩冉,刘磊,黄泽军,王孝宣,杜永臣,李君明,朱文莹,国艳梅. 2023

[9]水稻功能性插入缺失标记(InDel)的筛选与应用. 王钰,马卉,许学,秦瑞英,杨剑波,汪秀峰. 2019

[10]基于SNP和InDel标记的余甘子群体遗传分析. 普天磊,金杰,何璐,瞿文林,廖承飞,袁建民,罗会英,赵琼玲. 2023

[11]东北野生大豆核心种质单核苷酸多样性分析. 孟爽,赵洪锟,袁翠平,尹光,刘晓冬,王玉民,董英山,李建东. 2015

[12]基于InDel标记分析305份中国甘薯登记品种遗传多样性. 唐芬,赵路宽,苏一钧,肖世卓,袁蕊,翁宗宽,戴习彬,周志林,陈艳丽,曹清河. 2024

[13]利用InDel标记鉴定不同橘柚品种. 余歆,郭意,刘小丰,万润楚,江东,曹立. 2024

[14]基于SNP和InDel标记的巴西木薯遗传多样性与群体遗传结构分析. 孙倩,邹枚伶,张辰笈,江思容,Eder Jorge de Oliveira,张圣奎,夏志强,王文泉,李有志. 2021

[15]芝麻SNP和InDel标记遗传多样性、群体结构及连锁不平衡分析. 魏利斌,苗红梅,李春,段迎辉,徐芳芳,张海洋. 2017

[16]利用分子标记技术鉴定荔枝杂交后代的研究. 田婉莹,孙进华,李焕苓,张蕾,李松刚. 2015

[17]荔枝EST资源的SSR信息分析及EST-SSR标记开发. 孙清明,马文朝,马帅鹏,赵俊生,白丽军,陈洁珍,蔡长河,向旭,欧良喜. 2011

[18]荔枝基因组DNA提取与SSR反应条件优化. 姚庆荣,赵长增,王文泉. 2004

[19]海南部分荔枝种质资源亲缘关系的SSR分析. 姚庆荣,赵长增,王文泉. 2009

[20]SSR分子标记在荔枝上的研究进展. 欧良喜,向旭,狄凤香,白丽军,陈洁珍,孙清明. 2009

作者其他论文 更多>>

微信小程序