巴西橡胶树简单重复序列的鉴定及分离

文献类型： 中文期刊

第一作者： C.Bindu Roy

作者： C.Bindu Roy;田郎

作者机构：

关键词： 巴西橡胶树;简单重复序列;鉴定

期刊名称： 世界热带农业信息

ISSN： 1009-1726

年卷期： 2011 年 03 期

页码： 1-5

摘要： 本研究利用巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)这一重要产胶植物的基因组文库进行了简单重复序列(SSRs),也即微卫星序列的分离鉴定。对来自无性系GT1的小插入基因组文库进行SSRs(AC/TG及CT/GA基序)筛选鉴定共获得154个克隆。采用载体通用引物及重复序列进行PCR扩增发现,其中114个为阳性克隆。限制性酶切分析结果显示,这些阳性克隆中有6个为重复拷贝,故予以剔除。之后,对剩余108个克隆中的50个进行了序列分析。此外,试验中对来自优良无性系RRII105的大插入基因组文库也进行了筛选。所获24个阳性克隆的测序结果也证实了橡胶基因组中微卫星序列的存在。经过最终的序列分析,本研究共鉴定出67个具有不同特点的简单及复合型微卫星序列,其中59个来自GT1,其余8个来自RRII105。所检测到的重复基序包括二核苷酸(TG/AC,AG/TC,TA/AT),三核苷酸(AAG,AGG,ATT),四核苷酸(GAAA,AAGG,ATCC,TAAA,AAAT),以及一个五核苷酸(GAAAT)。与其它作物的报道结果类似,在橡胶基因组中也观察到大量的CT/GA重复。

分类号： S794.1

  • 相关文献

[1]巴西橡胶树TCTP基因结构分析及分子标记开发. 邓治,覃碧,冯福应,李德军. 2012

[2]橡胶树新种质抗寒性综合评价. 胡彦师,蔡海滨,安泽伟,华玉伟,方家林,黄华孙. 2012

[3]玉米O2和Wx基因内及O16基因连锁SSR位点的等位变异研究. 杨留启,杨文鹏,牛素贞,王明春. 2009

[4]12份糯玉米自交系的SSR标记多态性和分子分类研究. 杨留启,杨文鹏,王明春,任洪. 2009

[5]基于EST数据的柞蚕SSR标记开发. 郑茜茜,马红方,谌苗苗,钟亮,李群. 2016

[6]绒毛状烟草基因组中SSR位点的信息分析. 王卫锋,晁江涛,龚达平,王鲁,李凤霞,陈雅琼,孙玉合. 2011

[7]稻瘟病菌株CH63和TH16杂交组合的遗传图谱构建及无毒基因定位. 王艳丽,Claudia KAYE,Amandine BORDAT,Henri ADREIT,Jo■lle MILLAZZO,郑小波,沈瑛,Didier THARREAU. 2005

[8]黑木耳59个菌株的遗传多样性分析. 潘春磊,王延锋,盛春鸽,王金贺,张鹏,于海洋. 2022

[9]基于遗传多样性构建金针菇的核心种质群体及分子身份证. 高利慧,鲍大鹏,徐珍,李燕,陆欢,TAN Yee Shin,尚晓冬,陈洪雨,王瑞娟,吴莹莹. 2021

[10]籼稻脂肪酶基因的遗传分析及定位. 龚继平,吴方喜,吴跃进,郑家团,黄庭旭,王乌齐,张建福,谢华安. 2008

[11]花椰菜转录组SSR位点分析及其分子标记开发. 林珲,李永平,薛珠政,陈敏氡,朱海生,温庆放. 2019

[12]利用SSR分析普通野生稻自然居群交配系统. 刘勇,段永红,王淑红,詹庆才,孙桂华,高立志. 2010

[13]简单重复序列(AAG)_5在百萨偃麦草染色体上的分布. 温辉芹,裴自友,任永康. 2011

[14]湖北巴东县野生茶树种质资源遗传多样性及种群结构亲缘关系分析. 崔清梅,梁金波,马会杰,胡双玲,陈清华,吴立赟,何梦迪,王留彬,谭立才,张强,王丽鸳. 2024

[15]黄颡鱼遗传图谱构建及生长相关性状的QTL定位. 葛学亮,尹洪滨,毕冰,孙中武. 2010

[16]基于全基因组序列的香菇商业菌种SSR遗传多样性分析及多位点指纹图谱构建的研究. 张丹,宋春艳,章炉军,巫萍,鲍大鹏,尚晓冬,谭琦. 2014

[17]马铃薯基因组编码区域SSR位点的分布、特征和所编码蛋白功能分析. 孙亭亭,王大伟,陈乐,王卫峰,龚达平,陈雅琼,孙玉合. 2015

[18]大豆疫霉ISSR-PCR反应体系的建立. 李莹,文景芝,刘春来. 2005

[19]84个茶树品种遗传多样性及亲缘关系的SSR分析. 董丽娟,段继华,李赛君,张曙光. 2011

[20]橄榄果实转录组SSR和SNP/InDel位点特征. 赖瑞联,沈朝贵,冯新,陈义挺,韦晓霞,吴如健. 2023

作者其他论文 更多>>

微信小程序