从云南蚕区分离BmCPV病毒株的全基因组克隆与系统发育分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张永红

作者： 张永红;唐芬芬;邵榆岚;朱峰;白兴荣

作者机构：

关键词： 家蚕质型多角体病毒;分离株;基因组片段;系统进化;RNA聚合酶基因;多角体蛋白基因

期刊名称： 蚕业科学

ISSN： 0257-4799

年卷期： 2015 年 41 卷 06 期

页码： 1036-1043

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 家蚕质型多角体病毒(BmCPV)是家蚕中肠型脓病的病原物。从云南蚕区的病蚕样品中分离到一株BmCPV病毒分离株,提取纯化该病毒粒子的总RNA并合成cDNA,克隆病毒全基因组序列,研究该病毒分离株的基因组结构与系统进化。克隆得到该病毒10条dsRNA序列(S1~S10)并提交至NCBI数据库中。序列分析表明该病毒基因组序列全长24810bp,S1~S10片段序列都具有完整的ORF。BLAST比对发现克隆的该病毒基因组各片段编码区序列与已报道的1型BmCPV片段的相似度达88%以上,氨基酸序列相似度达90%以上;10条dsRNA基因组片段末端均有保守帽子结构5'-AGUAA……GUUAGCC-3'。基于S2片段RdRp基因的系统进化分析发现,该病毒与其他3个1型BmCPV分离株BmCPV1-Suzhou、BmCPV1-China、BmCPV1-Ⅰ聚为一支,基于S10片段polh基因的系统进化分析也表明该病毒为1型BmCPV新的分离株系。根据上述研究结果将该病毒定名为BmCPV1-Yunnan。

分类号： S884.5

  • 相关文献

[1]氯溴异氰尿酸及其复配药液对家蚕主要病原体的消毒效果试验. 李云芝,刘文光,石瑞常,顾寅钰,胡自江,衣葵花,朱红. 2013

[2]家蚕蜕皮激素22激酶2(BmEcK2)的序列及基因表达特征分析. 尚梦珂,高坤,郭锡杰,耿涛,姜晓旭. 2016

[3]水稻黑条矮缩病毒基因组片段S10的cDNA克隆及全序列分析. 张恒木,陈剑平,薛庆中,雷娟利. 2002

[4]水稻瘤矮病毒基因组结构与功能研究进展. 郑燕梅,吴春珠,蔡巨广,郑建华,方珊茹,赵明富. 2006

[5]基于高密度基因芯片的福恢2165重要农艺性状分子基础解析. 郑菲艳,毛莹莹,洪永河,周鹏,胡荣华,张帆涛,涂诗航. 2024

[6]家蚕核型多角体病毒株系的分子鉴定初探. 唐芬芬,邵榆岚,钟健,张永红,黄平,董占鹏,廖鹏飞,白兴荣. 2014

[7]茶毛虫核型多角体病毒ph基因抗体的制备与利用. WANG Li-zhong,肖强,ZHANG Chuan-xi. 2008

[8]国内新型基因2型牛病毒性腹泻病毒研究进展. 张倩,陶洁,张东,区炳明,林航,杨颖,张信军,朱礼倩,王建业,贺生中,孟婷,谢静,朱国强. 2017

[9]我国鸭肝炎病毒分离株基因组的测定与分析. 马秀丽,宋敏训,于可响,廖明,辛朝安. 2009

[10]新城疫LaSota活疫苗对基因Ⅶ型分离株的免疫保护性试验. 胡北侠. 2013

[11]伪狂犬病病毒TJ-1株生物学特性研究. 韩伟,张莉,鄢明华,李秀丽,高俊成,韩孝党. 2012

[12]猪圆环病毒2型不同分离株体内增殖特性的研究. 王小敏,周忠涛,汪伟,温立斌,郭容利,何孔旺. 2019

[13]我国鸡传染性支气管炎病毒分离株LX4mRNA1cDNA的分子特征. 刘胜旺,刘玉芬,孔宪刚. 2003

[14]蛋鸡J亚群禽白血病病毒3'非编码区序列特征分析. 高玉龙,贠炳岭,秦立廷,潘伟,王永强,高宏雷,祁小乐,王笑梅. 2012

[15]我国大陆地区PRRSV的遗传衍变分析. 安同庆,田志军,冷超良,彭金美,周艳君,李冉,童光志. 2010

[16]中国发现绵羊泰勒虫. 李有全,刘志杰,关贵全,马米玲,刘爱红,任巧云,罗建勋,殷宏. 2011

[17]连续传代时感染斜纹夜蛾核多角体病毒不同分离株的毒力变化. 郭慧芳,方继朝,王节萍,刘宝生,钟万芳. 2007

[18]斜纹夜蛾核型多角体病毒不同分离株基因序列的同源性分析. 刘艳荷,方继朝. 2008

[19]番鸭源新城疫病毒全基因组序列分析. 施少华,黄瑜,崔尚金,李曦,程龙飞,傅光华. 2006

[20]牛腺病毒3型黑龙江分离株全基因组序列分析及其对实验动物致病性的研究. 薛飞,朱远茂,史鸿飞,蔡红,于作,马磊,王姝,严昊,王雪枝. 2013

作者其他论文 更多>>

微信小程序