磁珠富集法分离草鱼微卫星分子标记
文献类型: 中文期刊
第一作者: 孙效文
作者: 孙效文;鲁翠云;梁利群
作者机构:
关键词: 磁珠富集;草鱼;微卫星分子标记
期刊名称: 水产学报
ISSN: 1000-0615
年卷期: 2005 年 29 卷 04 期
页码: 52-56
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 磁珠富集法是一种快速、高效的分离微卫星分子标记的方法。本研究通过该方法分离草鱼的微卫星分子标记。将草鱼(Ctenopharyngodon idella)基因组DNA经Sau3AI酶切,回收纯化400~900bp片段,连上接头,构建“基因组PCR文库”。用生物素标记的简单重复序列(CA)15作探针与其杂交,杂交复合物结合到包被有链霉亲和素的磁珠上,经一系列的洗涤过程,去除磁珠表面不含有微卫星的片段。将吸附在磁珠上的片段洗脱,PCR扩增放大,再进行克隆和测序,根据微卫星两端的保守序列设计引物,即可得到微卫星分子标记。本研究又通过同位素标记的探针(CA)15进行二次杂交筛选,获得阳性克隆132个,所得到的阳性克隆经测序,86.36%含有微卫星序列,共获得130个微卫星DNA序列。用引物设计软件PrimerPremier5.0设计引物83对。
分类号: S965.112
- 相关文献
[1]草鱼种群SSR分析中样本量及标记数量对遗传多度的影响. 李鸥,赵莹莹,郭娜,鲁翠云,孙效文. 2009
[2]基于SSR分子标记检测褐飞虱交配次数及性选择. 荆胜利,郑新静,李亚楠,张丽,余青青,黄小燕,杜波,杨芳,刘清松. 2021
[3]3个尖塘鳢引进群体繁育后代的遗传多样性分析. 林明辉,朱华平,苏换换,樊佳佳,池金泉,马冬梅. 2021
[4]利用SSR标记分析19份山羊草属种D基因组遗传多样性. 李俊,胡晓蓉,陈华华,魏会廷,杨武云. 2007
[5]白缘缺微卫星分子标记的筛选. 孙效文,杨彦豪,龙华,鲁翠云,佟广香,梁利群. 2006
[6]中国冬、春性小麦品种遗传多样性的微卫星标记分析. 杨慧勇,林凡云,陆琼娴,徐剑宏,史建荣. 2007
[7]微卫星分子标记技术在大黄鱼增殖放流效果评估中的应用. 吴利娜,张凝鋆,孙松,袁吉贵,陈佳,李苗苗,林楠,游宇,王伟继,丁少雄. 2021
[8]白缘(鱼央)微卫星分子标记的筛选. 孙效文,杨彦豪,龙华,鲁翠云,佟广香,梁利群. 2006
[9]扁吻鱼微卫星的筛选及群体多样性分析. 郝卓然,梁利群,常玉梅,唐然,李世国,任波. 2012
[10]小麦杂种优势群研究 Ⅴ.微卫星分子标记遗传距离与普通小麦和斯卑尔脱小麦种间杂种优势的关系. 崔国惠,倪中福,吴利民,李元清,孙其信. 2002
[11]基于简化基因组测序宽鳍鱲的微卫星分子标记及遗传多样性分析. 覃宁,张桂蓉,马徐发,魏开建. 2024
[12]SSR标记分析小麦品种Flinor和铭贤169的遗传差异. 冯晶,蔺瑞明,章振羽,曹远银,徐世昌. 2009
[13]基于微卫星分子标记的中国瓜实蝇不同地理种群遗传分化分析. 张亚楠,牛黎明,周世豪,龚治,李磊,张方平,韩冬银,符悦冠. 2018
[14]花生微卫星分子标记研究策略. 周桂元,梁炫强. 2004
[15]磁珠富集法开发长臀鮠微卫星分子标记. 孔杰,蒋晓红,周洲,张竹青,周路,李道友. 2016
[16]合浦珠母贝基因组微卫星富集文库的构建与分析. 油九菊,范嗣刚,黄桂菊,郝博飞,陈飞飞,喻达辉. 2015
[17]基因组微卫星DNA位点的分离方法及其在水产动物中的应用. 李莉好,喻达辉. 2006
[18]高效中华绒蟹微卫星文库的构建及其七个位点的特征分析. 朱泽远,顾洪如,施用晖,乐国伟. 2008
[19]用磁珠富集法从AFLP片段中分离鹅微卫星DNA标记. 屠云洁,陈宽维,章双杰,汤青萍,高玉时. 2005
[20]火红熊蜂微卫星标记的筛选及种特异性分析. 安建东,黄家兴,董捷,周冰峰. 2011
作者其他论文 更多>>
-
鲤PPARγ基因序列特征及其与脂肪沉积的相关性
作者:周佳;刘天奇;孙志鹏;吉宇丹;鲁翠云;曹顶臣;郑先虎
关键词:鲤;PPARΓ基因;基因表达;脂肪沉积
-
基于线粒体COⅠ基因序列的梭鲈野生群体遗传结构
作者:鲁翠云;孙志鹏;曹顶臣;耿龙武;那荣滨;吴学工;郑先虎
关键词:梭鲈;线粒体COⅠ基因;野生群体;遗传结构
-
乌苏里江饶河段鱼类的早期资源及其产卵场位置推测
作者:刘嘉成;王继隆;李培伦;鲁翠云;张辉
关键词:乌苏里江;鱼类早期资源;种类组成;环境因子;典范对应分析
-
梭鲈快速生长品系F3基因型与生长性状关联分析
作者:潘亚丹;鲁翠云;孙志鹏;刘天奇;张渴新;郑先虎
关键词:梭鲈;基因型;生长性状;关联分析
-
黑龙江流域草鱼养殖群体种质特征
作者:王瑞;鲁翠云;孙志鹏;刘天奇;常玉梅;刘鹏;曹庆;郑先虎
关键词:草鱼;形态性状;肌肉营养成分;酶活性;单核苷酸多态性
-
用微卫星标记分析卵形鲳鲹两个繁育群体的遗传结构
作者:鲁翠云;罗鸣;郑先虎;刘龙龙;张国庆;刘天奇;陈有铭
关键词:卵形鲳鲹;微卫星;繁育群体;遗传结构
-
梭鲈营养需求与饲料研究进展
作者:赵杰;郑先虎;刘洋;孙志鹏;徐艺华;鲁翠云
关键词:梭鲈;营养需求;配合饲料