锦鲤let-7家族系统进化、靶基因预测及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李泓

作者： 李泓;田月瑶;崔开明;秦楠;范道省;田雪;朱文锦

作者机构：

关键词： 锦鲤;let-7家族;系统进化;let-7j;靶基因;体色

期刊名称： 河南农业科学

ISSN： 1004-3268

年卷期： 2025 年 54 卷 001 期

页码： 144-152

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对锦鲤let-7家族成员的前体序列进行比对和系统进化分析，检测锦鲤let-7家族成员表达量在体色形成过程中的变化，通过TargetScan和miRWalk对let-7j的靶基因进行预测，并对靶基因的本体特征和代谢通路进行富集分析，为了解let-7家族的进化历史及其在锦鲤及硬骨鱼类体色形成中的作用提供参考。结果表明，锦鲤let-7家族成员在鱼类中高度保守，且其前体序列的5'端保守性高于3'。锦鲤let-7家族成员表达量在体色形成的4个阶段均表现为逐步升高的趋势，在体色完全形成的孵化后47 d达到最高。利用TargetScan和miRWalk对let-7j的靶基因进行预测，其中571个靶基因在2个软件中均被预测到，这571个候选靶基因富集到了10个与体色形成相关的GO条目，包括色素沉积、发育过程的色素沉积、色素细胞分化、黑色素细胞分化、细胞色素沉积、黑色素小体转运、色素颗粒转运、色素代谢过程、黑色素小体定位的建立和黑色素小体定位；富集到与体色相关的KEGG调控通路主要有Wnt信号通路、ErbB信号通路和黑色素沉积通路。以上GO和KEGG通路中存在ltk、pmel、plin6、kitlga和pax7a等多个与色素细胞分化和迁移相关的基因。综上，let-7家族成员在鱼类进化过程中高度保守，可能靶向色素细胞分化相关的基因参与锦鲤红色体色的形成。

分类号： S917.4

  • 相关文献

[1]锦鲤microRNA-137系统进化、靶基因验证及表达分析. 李俊茹,马晓,吴利敏,刘慧芬,石西,宋红梅,田雪,李学军. 2021

[2]褪黑激素对内蒙古绒山羊皮肤中let-7家族及其靶基因的影响. 王建蒙,付绍印,丽春,白雪,刘斌,季小阳,刘永斌,张文广. 2019

[3]四种增色剂对锦鲤的生长、形体、体色和抗氧化能力的影响. 李建光,胡世然,刘霆,张竹青,江晓峰,王朝明,罗莉. 2009

[4]锦鲤“御三家”新品系的选育. 史东杰,梁拥军,孙砚胜,张欣,张升利. 2014

[5]饲料脂肪水平对锦鲤体色和几项免疫指标的影响. 孙向军,罗琳,姜志强,孙砚胜,史东杰,梁拥军. 2011

[6]水晶彩鲫、红鲫和锦鲤的腹膜脏层黑色素观察. 徐伟,李池陶,曹顶臣,尹家胜. 2007

[7]锦鲤墨蝶呤还原酶基因的克隆、表达和定位分析. 胡菊,冯彩,马晓,吴利敏,刘慧芬,宋红梅,胡隐昌,田雪,李学军. 2020

[8]人工雌核发育红草金鱼体色的定向发育研究. 程云生,侯冠军,杨坤,陈静,高雷,何吉祥. 2015

[9]红白锦鲤GTP环化水解酶1基因(Gch1)的表达及其进化分析. 李晓敏,李炯棠,肖贵宝,宋迎楠,王秀利,孙效文. 2015

[10]发酵南极磷虾粉替代鱼粉对锦鲤生长、体色及血清生化指标的影响. 付豪,宋红梅,牟希东,田雪,刘超,刘奕,杨叶欣. 2023

[11]水晶彩鲫、红鲫、锦鲤、荷包红鲤杂交子代的生长和体色研究. 徐伟,曹顶臣,李池陶,匡友谊,尹家胜. 2005

[12]饲料中添加抗菌肽对锦鲤生长、非特异性免疫力和抗病力的影响. 林鑫,毛述宏,杨阳,林仕梅,罗琳. 2013

[13]鱼类常用催产剂对锦鲤人工繁殖效果的影响. 史东杰,孙砚胜,李文通,孟素宣,梁拥军,张升利,张欣,朱莉飞. 2015

[14]锦鲤源铜绿假单胞菌的分离鉴定及药敏试验. 陈凯,梁利国,谢骏. 2015

[15]利用微卫星标记分析长鳍鲤、锦鲤和龙凤鲤的遗传多样性. 孙莉,杨国梁,王军毅,吴婷婷,张海波,吴添文,陈国宏. 2009

[16]锦鲤酪氨酸酶基因序列分析及其在不同锦鲤品系不同组织中的表达. 王巍,胡红霞,孙向军,牛翠娟. 2012

[17]氨氮对锦鲤相关酶活性和基因表达的影响. 史东杰,朱华,张欣,王文峰,孙砚胜. 2019

[18]戊二醛对锦鲤的急性毒性研究. 董少杰,梁拥军,孙向军,杨广. 2012

[19]微生态制剂对锦鲤生长、消化酶活性和表观消化率的影响. 史东杰,梁拥军,许金华,孙砚胜,张欣. 2017

[20]增艳物质对锦鲤生长性能和生理机能的影响. 胡显琼,叶元土,罗琳,蔡春芳,向朝林,朱磊,王永庆,姚林杰,刘猛,许凡,王丽宏,萧培珍. 2011

作者其他论文 更多>>

微信小程序