拟南芥抗旱转录因子CBF4基因区域的核苷酸多样性及其分子进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郝岗平

作者： 郝岗平;吴忠义;曹鸣庆;Georges Pelletier;Dominique Brunel;黄丛林;杨清

作者机构：

关键词： 拟南芥;CBF4基因;核苷酸多样性

期刊名称： 遗传学报

ISSN： 0379-4172

年卷期： 2004 年 31 卷 12 期

页码： 1415-1425

收录情况： SCI ; 北大核心 ; CSCD

摘要： 以生长于不同气候条件下的 17个拟南芥核心生态型为材料 ,分析了它们的抗旱转录因子CBF4基因区域的序列多态性。结果表明 :拟南芥CBF4基因区域具有高密度的单核苷酸多态性 (SNP)和插入缺失 (Indel) ,多态性频率为每 35 8bp一个SNP ,每 14 3bp一个Indel,基因非编码区的多态性是编码区的 4倍 ;在编码区 ,SNP的频率为每 96 4bp一个SNP ,其中发现 2 5av、2 0 3av和 2 4 4av 3个生态型CBF4基因区域 10 34位 (以GenBank登录号AB0 15 4 78序列第 196 96位的核苷酸为 1)碱基变化 :G T ,引起第 2 0 5位氨基酸变化 :gly val。核苷酸多样性统计分析显示 ,该基因内部大范围内存在连锁不平衡 (linkagedisequilibrium ,LD) ,5′端非编码区有一个重组。与拟南芥等的研究结果类似 ,选择压力对不同的区域作用不同。 3′端非编码区核苷酸多样性程度最高 ,是平衡性选择的结果 ,编码区核苷酸变化符合中性突变假说 ,而 5′端非编码区是自然选择作用的靶位点

分类号： Q943.2

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