基于热溶解膜过滤法的太岁古菌菌群结构研究
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王朝江
作者: 王朝江;王世清;李慧;信艳杰;高春燕
作者机构:
关键词: 太岁;热溶解膜过滤法;古菌结构;甲烷杆菌属
期刊名称: 生命科学研究
ISSN: 1007-7847
年卷期: 2021 年 25 卷 004 期
页码: 355-362
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为获知太岁中古菌准确的菌群结构及分析其与原有结果的不同,在太岁组织表里层不同位置重复取样,采用适合太岁材料特性的热溶解膜过滤法处理后提取DNA,随后利用Illumina MiSeq高通量测序平台测定古菌16SrDNA V3~V4区扩增序列.结果显示:供试太岁所含古菌分属16个门、27个纲、39个目、64个属,相对丰度大于0.01%的属有22个;表层的多样性高于里层,由外至内有物种消失现象;重复取样间存在大量非共有菌群;甲烷杆菌属(Methanobacterium)是有高丰度OTU支撑的优势菌群,相对丰度在43.859 5%~96.811 0%,是用常规方法提取DNA测知的优势属中,唯一仍保持优势地位的属,且在内部样品中的相对丰度较之前测定值分别提升39.554 2%和65.924 4%.上述结果表明,甲烷杆菌属是太岁所含古菌的优势菌群,在其形成中存在作用.
分类号: Q938
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