基于简化基因组测序评价太湖鹅不同保种场的保种效果

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘宏祥

作者： 刘宏祥;朱满兴;秦豪荣;宋卫涛;朱春红;陶志云;徐文娟;章双杰;李慧芳

作者机构：

关键词： 鸭;保种;简化基因组测序

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2018 年 S1 期

页码： 94-99

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在评价太湖鹅原种场和国家水禽基因库的保种效果,为进一步更好地对太湖鹅进行保种打下理论依据。利用ddRAD简化基因组测序方法鉴定太湖鹅原始群体(TS)、原种场群体(TC)和基因库群体(TK)的SNP标记,比较分析3个群体的遗传多样性差异,并使用遗传分化系数FST和核苷酸多样性π比值联合筛选选择信号区域及其相关基因,对得到的受选基因进行GO和KEGG功能富集分析。结果发现,与原始群体相比,原种场群体和基因库群体的遗传杂合度均有降低,近交系数上升,且基因库群体与原始群体、原种场群体有中度分化的趋势。原种场群体的脂类代谢相关基因受到了一定程度的选择。结果表明,原种场群体和基因库群体应适当增加保种群数量,避免近交系数上升过快,且基因库群体应加强与原种场群体的基因交流,避免与原始群体、原种场群体的过度分化。

分类号： S835

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