苏博美利奴羊毛囊发育不同时期ncRNA调控网络的构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张小伟

作者： 张小伟;何军敏;徐新明;田月珍;关鸣轩;张漫;付雪峰;哈尼克孜?吐拉甫;黄锡霞;田可川

作者机构：

关键词： miRNA;lncRNA;mRNA;毛囊发育;调控网络;苏博美利奴羊

期刊名称： 中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2022 年 58 卷 007 期

页码： 122-133

收录情况： 北大核心

摘要： 为探索苏博美利奴羊毛囊发育相关ncRNA分子调控网络,本研究通过挖掘苏博美利奴羊皮肤组织样本不同时期转录组数据,利用生物信息学方法构建lncRNA-miRNA-mRNA分子调控网络.结果表明:不同时期mRNA与lncRNA及miRNA具有复杂的网络连接.通过GO富集分析发现靶基因主要参与细胞增殖调控、凋亡过程及毛囊形态发生等生物学过程;参与细胞外空间、细胞外泌体、转录因子复合体、质膜的整体成分等细胞组分;参与转录因子活性、结构分子活性、细胞外基质结构组成等分子功能.通过KEGG通路分析发现差异的靶基因主要参与TGF-beta信号通路、癌症途径、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、细胞因子与细胞因子受体的相互作用等多种途径.筛选寻找调控网络中的关键基因,发现G2 vs.G1组中miR-133、miR-433-5p的靶基因TGFβ2和NOTCH1参与毛囊形态发生(GO:0031069)的生物学过程,因此TGFβ2和NOTCH1为毛囊发育的关键基因.通过构建苏博美利奴羊毛囊发育相关ncRNA分子调控网络,解析毛囊发生发育的分子调控机制,从转录组学层面对毛囊生长发育进行探讨,能够对苏博美利奴羊毛囊发育的分子作用机制进行系统性挖掘.

分类号： S826.2

  • 相关文献

[1]冷应激后民猪背脂中差异lncRNA的筛选与分析. 马骏杰,汪亮,刘娣,张冬杰,杨秀芹. 2021

[2]基于转录组学筛选与哺乳动物睾丸发育相关基因及调控网络的研究进展. 孙武,罗静,李发弟,李万宏,乐祥鹏. 2018

[3]苏博美利奴羊毛囊发育不同时期皮肤组织LncRNAs及其靶基因的差异表达. 朱桦,黄锡霞,田可川,何军敏,付雪峰,赵冰茹,徐新明,田月珍,阿布来提·苏来曼,陈华峰. 2018

[4]Dsg4基因在苏博美利奴羊毛囊发育不同时期及不同组织中的表达差异. 朱桦,潘家华,徐新明,付雪峰,田月珍,阿布来提·苏来曼,黄锡霞,田可川. 2018

[5]DNMTs基因在苏博美利奴羊皮肤毛囊发育不同时期的表达分析. 曾伟丹,赵冰茹,范雪,楚高洁,徐新明,付雪峰,黄锡霞,田可川. 2020

[6]影响山羊胎儿肌肉发育mRNA和lncRNA的鉴定与分析. 叶峻宁,邓铭,薛慧雯,柳广斌,邹娴,孙宝丽,郭勇庆,刘德武,李耀坤. 2023

[7]植物非编码RNA及其在甜菜中的应用研究. 李任任,吕春华,於丽华,耿贵. 2019

[8]畜禽肌内脂肪沉积的基因调控及其作用机制. 汪凯歌,闫俊书,宦海琳. 2024

[9]非编码RNA调控畜禽肌内脂肪沉积的研究进展. 齐婧,谭娅,王婧,张静,赵春萍,张正群,史开志. 2022

[10]野鸟源H9N2亚型流感病毒感染小鼠的ceRNA调控机制研究. 刘慧珍,姚秋成,高玉伟,葛叶. 2023

[11]RNA分子在植物韧皮部长距离运输的研究进展. 李苹芳,羊杏平,徐锦华,刘广,姚协丰,高长洲,朱凌丽. 2013

[12]日粮粗蛋白质水平对苏博美利奴羊生长性能、消化代谢及血清生化指标的影响. 王春昕,赵云辉,赵卓,朱景良,翟博,赵凤江,张明新. 2016

[13]绵羊FGF5基因Exon 3多态性对毛用性状的影响. 张立春,尹峰,柳俭强,李梦姝,王春昕,曹阳,朴庆林,金海国,张明新. 2018

[14]苏博美利奴羊核心群级进杂交不同世代对产毛性状影响的研究. 柳楠,田可川,石国庆,贺建宁,刘积凤,狄江,杨永林. 2015

[15]Hoxc13基因在苏博美利奴羊胎羔生长发育期不同组织中的表达分析. 杜建文,何军敏,陈春艳,田月珍,徐新明,付雪峰,哈尼克孜·吐拉甫,赵冰茹,朱桦,黄锡霞,田可川. 2019

[16]苏博美利奴羊皮肤组织中WNT2基因的DNA甲基化与表达量分析. 杨雪梅,徐新明,付雪峰,杜建文,王丹,田月珍,田可川,黄锡霞. 2020

[17]苏博美利奴羊胎儿皮肤毛囊结构及形态发育. 阿布来提·苏来曼,田月珍,许琴,何军敏,赵冰茹,徐新明,付雪峰,热娜古丽·艾尼瓦尔江,黄锡霞,田可川. 2017

[18]不同羊毛纤维直径细毛羊MYL6基因克隆及差异表达研究. 付雪峰,黄锡霞,刘春洁,徐新明,张艳花,吴伟伟,于丽娟,石刚,田可川. 2016

[19]绵羊KAP8.2基因多态性及其与毛用性状相关性分析. 罗新惠,张立春,刘艳光,柳俭强,翟博,曹阳,肖成,金海国. 2021

[20]细毛羊育种目标性状的相关关系及差异分析. 杨存明,张晓雪,张梦华,赵志文,李峰洁,黄锡霞,李杰,艾孜买提·阿吾提,何军敏,李雪,李婷婷,唐丽,张文静,田月珍,田可川. 2024

作者其他论文 更多>>

微信小程序