芋[Colocasiaesculenta(L.) Schott]的倍性水平及基因组特征解析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 殷剑美

作者： 殷剑美;王立;蒋璐;韩晓勇;郭文琦;李春宏;张培通

作者机构：

关键词： 芋;流式细胞术;基因组测序;基因功能注释;倍型水平;基因组特征

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2019 年 06 期

页码： 1284-1291

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用流式细胞术,对2个芋[Colocasiaesculenta(L.) Schott]品种苏芋1号和香蕉芋的倍性水平和DNA含量进行了测定,2倍基因组DNA含量分别为7.71 pg和5.25 pg,倍性分别为三倍体和二倍体。同时通过HiSeq 2500测序,分别获得240.53 Gb和87.69 Gb数据,芋基因组大小为2.08～2.38 Gb,GC含量为42.57%～42.75%,杂合度为0.52%～2.29%。根据苏芋1号的基因组数据,组装得到基因组序列为2.27 Gb,Contig N50为359 bp;共注释获得24 302个基因,99.43%的基因可注释到6个公共数据库;筛选出928 987个SSR位点。

分类号： S632.3

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