影响猪免疫性状的单倍型关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 罗维真

作者： 罗维真;陈少康;张龙超;程笃学;颜华;李勇;王立刚;宋欣;马小军

作者机构：

关键词： 免疫性状;单倍型;关联分析;猪

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2013 年 44 卷 06 期

页码： 843-852

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在缩小课题组前期全基因组关联分析(Genome-wide Association Study,GWAS)结果区间范围,为下一步大规模群体验证提供有效候选基因。应用GWAS检验出的显著SNP标记构建单倍型,在大白猪×民猪F2设计资源群体内开展其与4个血常规指标(红细胞压积(Haematocrit,HCT)、血红蛋白(Hemoglobin,HGB)、平均红细胞血红蛋白量(Mean Corpuscular Hemoglobin,MCH)、平均红细胞体积(Mean Corpuscular Volume,MCV))和3个T细胞亚群指标(CD4+CD8-CD3+、CD4-CD8+CD3+和CD4+CD8-CD3+/CD4-CD8+CD3+)合计7个免疫性状指标的关联分析,寻找显著单倍型区段中的候选基因。分析结果表明:7号染色体上的3个单倍型区段均与T细胞亚群指标关联极显著,单倍型区段3(block7-3)与HGB及HCT关联极显著;8号染色体上3个单倍型区段均与MCH和MCV关联极显著,并由此定位5个候选基因:影响T细胞亚群指标的ABCF1和PPP1R10基因,影响HGB及HCT的GRM4基因,影响MCH及MCV的ALB和AFP基因。结合上述结果及基因功能,定位的5个基因可作为候选基因开展下一步研究。

分类号： S828

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