一种新的快速鉴定蛋白与靶DNA结合位点的方法

文献类型： 中文期刊

第一作者： 朱明

作者： 朱明;魏伟;陈明;张宪省;徐兆师;李连城;马有志

作者机构：

关键词： DNA酶I足迹法;EMSA;毛细管电泳;蛋白与DNA互作

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2011 年 37 卷 12 期

页码： 2167-2172

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： DREB转录因子在植物逆境胁迫响应中起非常重要的作用,对植物的生长发育起重要的调控作用。传统的DNA酶I足迹法应用同位素标记DNA,采用序列胶分离DNaseI酶切片段,操作较复杂,分辨率较低,不适用于高通量的样品检测。为阐明植物体内DREB转录因子的调控机制,本研究利用改进的DNA酶I足迹法(DNase I foot-printing)结合凝胶阻滞法(electrophoretic mobility shiftassay,EMSA),选用荧光色素代替同位素标记,毛细管电泳技术代替序列胶检测DNaseI酶切片段,判定GmMYB1蛋白与GmDREB3启动子DNA结合的区域。采用限制性内切酶酶切GmDREB3启动子DNA验证以上结果。同时,在判定的GmMYB1结合区域的基础上,选择可能的DNA结合元件与GmMYB1进行EMSA试验,证明GmMYB1可以与相应元件结合。该方法比传统的DNA酶I足迹法快速、简便、准确并可靠,作为一种高通量的鉴定方法可用于大规模鉴定蛋白质的DNA结合位点。

分类号： S184

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