菊苣的基因组大小估算及基因组调查测序

文献类型： 中文期刊

第一作者： 费星宇

作者： 费星宇;赵泓;杜洋;段梦琪;王晨晨;张彬;刘雪;李大勇;许立新

作者机构：

关键词： 菊苣(Cichoriumintybus L.);全基因组测序;流式细胞术;K-mer分析

期刊名称： 草地学报

ISSN： 1007-0435

年卷期： 2022 年 30 卷 012 期

页码： 3207-3214

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 菊苣(Cichoriumintybus L.)是一种多年生、药食同源的植物,既可作为蔬菜种植,也可作为优质牧草推广应用.本研究对'将军'(K042)这一具有较高饲用价值的菊苣牧草品种展开物种鉴定、染色体计数、基因组大小估算、调查测序及初步组装研究.系统进化分析表明,K042跟生菜的亲缘关系较近.染色体计数结果显示,K042体细胞有18条染色体(2n=18);流式细胞术实验结果显示,K042的基因组大小约为1170.00 Mb;二代Illumina HiSeq测序分析进一步估算K042基因组大小约为1424.00 Mb.K042基因组的杂合率为1.12%,重复序列含量为73.56%.K042基因组具有高重复、高杂合的复杂特征.根据基因组测序结果对K042展开基因组组装工作,组装后基因组大小为823.36 Mb,重叠群N50长度约为1.03 kb,本研究结果可为将来菊苣分子生物学和遗传育种研究提供重要的基因组学基础参考数据.

分类号： S548

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