冷应激后民猪肝脏的全转录图谱

文献类型: 中文期刊

第一作者: 张冬杰

作者: 张冬杰;汪亮;马守正;刘娣

作者机构:

关键词: 冷应激;民猪;肝脏;转录图谱;富集分析

期刊名称: 家畜生态学报

ISSN: 1673-1182

年卷期: 2025 年 46 卷 010 期

页码: 15-21

收录情况: 北大核心

摘要: 为了探讨民猪遭受冷应激后肝脏全转录组基因表达谱的变化,该研究以6头180日龄健康状况良好、体重相近(约55 kg)的雌性民猪为试验材料,随机分为2组,每组3头.将其中一组设为对照组,在18±3 ℃的舍内饲养,另一组设为试验组,在舍外半敞篷内饲养,全天温度在-15~-24 ℃之间.3 d后,6头试验猪同时屠宰,取肝脏组织进行全转录组测序分析,包括对mRNA、lncRNA和circRNA的鉴定及功能分析.结果表明:冷应激后,民猪肝脏内大量基因的转录水平发生了显著变化,371个mRNA、82个lncRNA和34个circRNA显著上调(P<0.05);633 个 mRNA、76 个 lncRNA 和 33 个 circRNA 显著下调(P<0.05);针对表达差异的mRNA、lncRNA的靶基因以及circRNA的来源基因进行GO功能注释及Pathway富集分析,发现冷应激下,肝脏内的脂肪沉积、氨基酸代谢、细胞外基质与细胞表面受体之间的相互作用通路、氧化磷酸化过程等发生了显著变化.由此可知,冷应激下,民猪肝脏组织与能量代谢、信号转导等相关通路被激活,作为基因转录组重要组成部分的mRNA、lncRNA和circRNA表达发生变化,它们在民猪抵抗冷应激过程中发挥重要作用.

分类号: S811.5%S828.2

  • 相关文献

[1]冷应激下民猪黑素皮质素受体基因的表达变化. 张冬杰,刘娣. 2012

[2]利用Affymetrix芯片分析民猪冷应激后肌肉组织的基因表达谱. 张冬杰,刘娣,别墅,孙洪涛,汪亮,王文涛,何鑫淼. 2011

[3]冷应激后民猪肝素结合性表皮生长因子基因表达研究. 张冬杰,刘娣,汪亮,别墅,孙洪涛,杨国伟. 2011

[4]冷应激后民猪背脂中差异lncRNA的筛选与分析. 马骏杰,汪亮,刘娣,张冬杰,杨秀芹. 2021

[5]冷应激对民猪肌肉组织中抗氧化相关基因表达的影响. 王芳,马红,刘娣. 2024

[6]重度冷应激下民猪背最长肌应答分子调控网络分析. 马守正,汪亮,李忠秋,王文涛,刘娣,张冬杰. 2022

[7]马传染性贫血病毒基因组部分转录图谱. 刘相冬,张宝山,孔宪刚,王滨有,孙成群,刘永刚,周家喜,王凯波,刘建华. 2001

[8]民猪与皮特兰猪杂交猪肉质研究. 何鑫淼,刘娣. 2013

[9]绿壳蛋鸡与白来航蛋鸡microRNA变异及其靶基因预测分析. 管毓渝,廖荣荣,王振,赵静,陈振亮,张哲,肖倩,孙浩,王起山. 2016

[10]Enrich_analysis.pl,差异表达基因富集分析的perl脚本. 李旭凯,王钇杰,王俊杰. 2018

[11]太湖鹅4个群体保种效果的遗传评价. 刘宏祥,王健,宋卫涛,朱春红,陶志云,徐文娟,章双杰,李慧芳. 2021

[12]大肠杆菌O157:H7生物被膜状态下基因表达分析. 马蓝,彭晴,徐小轻,杨硕,张宇微,田丹丹,施琳波,石波,乔宇. 2023

[13]营养生长期持续高温处理对玉米叶片转录组及生化指标的影响. 陈岩,岳丽杰,刘永红,杨勤. 2022

[14]玉米抗感粗缩病重要miRNA及其靶基因的诠释. 吴斌,崔汉青,张眉,邵春国,姜珊珊,郭霞,徐德坤,王升吉. 2021

[15]大肠杆菌O157∶H7生物被膜状态下基因表达分析. 马蓝,彭晴,徐小轻,杨硕,张宇微,田丹丹,施琳波,石波,乔宇. 2023

[16]黄芪对冷应激断奶仔猪生理机能的影响. 周芬,王重龙,丁月云,殷宗俊. 2011

[17]急性冷应激对皖西白鹅某些神经内分泌活动的影响. 屠云洁,耿照玉,苏一军,姜润深,李国辉,陈国宏. 2009

[18]中草药红景天对冷应激断奶仔猪生理机能的影响. 周芬,丁月云,殷宗俊,王重龙. 2011

[19]肾上腺素对猪季节性基因表达的影响. 刘宇,马红,汪亮,刘娣. 2017

[20]不同添加剂对淮南麻黄鸡抗冷应激能力的影响. 许月英,李俊营,张永德,苏世广,任毅,吴义景,詹凯. 2010

作者其他论文 更多>>