桑黄9个萜类合成酶基因的鉴定及表达分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 李云琴

作者: 李云琴;王毅;张子蕴;原晓龙;杨焱;杨文忠

作者机构:

关键词: 桑黄;萜类合成酶;生物信息学分析;基因表达

期刊名称: 森林与环境学报

ISSN: 1001-389X

年卷期: 2021 年 004 期

页码: 402-409

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了解高等药用真菌桑黄的萜类合成酶(TPS)基因的功能,从桑黄全基因组中分离获得TPS基因,并对其进行生物信息学分析、系统发育树构建,分析其在不同碳源和氮源培养条件下的表达情况。结果表明:在桑黄基因组中分离出9个SsTPS基因,除SsTPS2蛋白质没有特征基序外,其余SsTPS蛋白质均具有TPS的典型特征基序;二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。9个SsTPS聚为2个支系,初步推测SsTPS1为倍半萜合成酶,且可以催化合成α-muurolene; SsTPS3、SsTPS4、SsTPS5、SsTPS9属于倍半萜合成酶,SsTPS3和SsTPS5合成δ-cadinene的类似物或衍生物,SsTPS4和SsTPS9分别合成β-copaene、α-muurolene的类似物或衍生物; Ss TPS2为三萜合成酶。Ss TPS1、Ss TPS4、Ss TPS6基因在所有培养基中均不表达,其余基因呈现差异化表达,Ss TPS7仅在添加肌醇为碳源、大豆蛋白粉为氮源的培养基中低量表达; Ss TPS2、Ss TPS3、Ss TPS5、Ss TPS8、Ss TPS9分别在添加果糖为碳源、大豆蛋白粉为氮源、牛肉浸粉为氮源、酵母粉为氮源、香蕉粉为氮源的培养基中表达量最高。基因簇分析显示,Ss TPS1和Ss TPS4编码基因所在contig有基因簇的存在。

分类号: S567.3

  • 相关文献

[1]杨树桑黄水提液对果蝇寿命和繁殖力及寿命相关基因的影响. 侯立娟,卯明娟,刘迪,蒋宁,周蓉云. 2023

[2]灰毡毛忍冬MADS-box基因家族AGL15基因的克隆、生物信息学和表达分析. 蔡嘉洛,朱贻霖,陈林,樊悦,刘峰,张亚丽,欧阳琳,刘湘丹. 2016

[3]糜子抗白粉病基因(Mlo)编码蛋白的序列特征及表达分析. 石甜甜,何杰丽,秦明月,陈凌,王海岗,王瑞云,乔治军. 2018

[4]小麦细胞分裂素受体基因TaHK1的生物信息学及表达特性分析. 孙丽静,赵慧,吕亮杰,张颖君,胡梦芸,刘茜,李辉. 2019

[5]玉米蔗糖转运蛋白基因ZmSUT4克隆及其低温胁迫下的表达模式. 弓雪,姜敏,齐欣,刘欣芳,卢生乔,陈坤,刘亚利,张述宽,马涛,杨耀迥. 2019

[6]‘富士’苹果Ca~(2+)/H~+反向转运蛋白基因生物信息学及表达模式分析. 程玉豆,冯云霄,关军锋. 2015

[7]荔枝漆酶(LAC)基因家族鉴定及表达分析. 李郑华,姜成东,王鹏,李芳,王树军,刘耀婷,李焕苓,王果,王家保. 2023

[8]小麦TaMICU1-6A基因的克隆、生物信息学及表达分析. 李欣,李鲁华,任明见,安畅,洪鼎立,赵鹏鹏,徐如宏. 2024

[9]绵羊MYL基因家族的鉴定与组织表达分析. 杨杨,余乾,刘昱成,杨华,赵卓,王立民,周平,杨庆勇,代蓉. 2024

[10]甘薯CLE多肽家族的全基因组鉴定和IbCLE12的克隆及抗旱性表达分析. 周媛媛,赵春玲,侯夫云,李爱贤,秦桢,王庆美,董顺旭. 2023

[11]甘蔗ScHAK10基因克隆及表达分析. 罗海斌,蒋胜理,黄诚梅,曹辉庆,邓智年,吴凯朝,徐林,陆珍,魏源文. 2018

[12]石榴蔗糖代谢相关酶SPS和INV基因家族鉴定与表达分析. 冯立娟,李英朋,王传增,尹燕雷,郭琳,谭伟. 2024

[13]高粱SBP基因家族鉴定及干旱胁迫下的表达模式分析. 姜昱雯,陈满静,赵应,任艳,周棱波,沈佳奇,邵明波. 2024

[14]水稻WOX家族基因鉴定及其种子在逆境萌发中的表达分析. 张琪,张爱霞,贾俊婷,赵华,刘军,陈兵先. 2022

[15]辣椒组蛋白去乙酰化基因家族分离鉴定及表达分析. 李涛,徐小万,黎振兴,王恒明,李植良,李颖. 2015

[16]大白菜LACS家族基因鉴定与表达分析. 王荣花,王树彬,刘栓桃,张志刚,李巧云,王立华,赵智中. 2022

[17]水稻核糖体失活蛋白家族基因OsRIP8的生物信息学与功能分析. 徐娅,黄佑岗,李树杏. 2024

[18]ghr-miR160负调控棉花叶片衰老机理研究. 段珊,喻树迅,窦玲玲,程帅帅,郭亚宁,庞朝友,马启峰,魏恒玲,范术丽,王寒涛. 2018

[19]向日葵查尔酮合酶HaCHS基因的克隆与逆境应答. 马立功,张匀华,孟庆林,石凤梅,刘佳,李易初,王志英. 2016

[20]甘蔗ScHAK9基因克隆及表达分析. 罗海斌,黄诚梅,蒋胜理,曹辉庆,邓智年,吴凯朝,徐林,陆珍,魏源文. 2018

作者其他论文 更多>>