干旱胁迫下杂草稻和栽培稻根系基因表达差异研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 丁国华

作者： 丁国华;孙健;杨光;张凤鸣;白良明;孙世臣;姜树坤;王彤彤;郑洪亮;夏天舒;沈希宏;马殿荣;陈温福

作者机构：

关键词： 杂草稻;根系;表达谱芯片;耐旱

期刊名称： 中国水稻科学

ISSN： 1001-7216

年卷期： 2016 年 30 卷 05 期

页码： 458-468

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用Affymetrix水稻表达谱芯片(GeneChip Rice Genome Array)研究抗旱杂草稻HEB07-2与巴西陆稻(IAPAR9)在PEG模拟干旱胁迫下根系基因表达变化。结果表明,杂草稻HEB07-2转录组对干旱信号的响应程度与方向均与巴西陆稻存在很大差异,HEB07-2以正向调控为主,而巴西陆稻以负调控为主。干旱胁迫下杂草稻HEB07-2与巴西陆稻分别有6878个和2923个基因表达,其中HEB07-2受干旱胁迫诱导上调的基因有4693个,下调的基因有2185个;而巴西陆稻则分别有983个和1940个。在差异基因表达的倍数上也是HEB07-2高于巴西陆稻。进一步的GO分析表明,在干旱胁迫下,HEB07-2和IAPAR9根系基因响应途径的差异表现为HEB07-2在钾离子转运(GO:0006813)、次生物质代谢(GO:0019748)、细胞生长(GO:0016049)、葡萄糖代谢(GO:0006006)、跨膜离子转运器活性(GO:0015075)、亚铁血红素结合体(GO:0020037)、氧化还原酶活性(GO:0016491)等方面基因显著上调,这与生理数据和表型数据一致。

分类号： S511`S451

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