茶树果胶乙酰酯酶家族成员的鉴定和生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 刘艳丽

作者: 刘艳丽;马林龙;曹丹;金孝芳;冯琳;龚自明

作者机构:

关键词: 茶树;果胶乙酰酯酶;鉴定;生物信息学分析

期刊名称: 茶叶科学

ISSN: 1000-369X

年卷期: 2019 年 005 期

页码: 521-529

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 茶树是氟的超富集植物,叶片高氟含量与人体健康密切相关.果胶乙酰酯酶(PAE)可能通过调控果胶的去乙酰化作用参与茶树叶片对氟的富集和解毒,然而目前并无茶树PAEs的相关报道.本研究以茶树舒茶早基因组和三代测序数据为基础,利用生物信息学的方法开展了PAEs的鉴定及其特性、进化和定位分析.结果表明,在茶树中,PAE家族有12个蛋白,属于PAE5、PAE8、PAE9、PAE10、PAE12等5个成员,具有CLDG、PxYH、GGGWC、GS、NWN、rYCDG、GCSAG、NaAYDSWQ、HCQ等9个保守基序;在进化关系上,茶树PAEs与葡萄、可可亲缘关系较近;12个CsPAEs氨基酸大小为326~515,分子量为36.7~56.9 kDa,等电点为5.1~8.9;除CsPAE5、CsPAE5-1定位线粒体,CsPAE10-1可能定位胞质外,其他9个CsPAEs定位细胞壁;CsPAE5、CsPAE5-1、CsPAE12和CsPAE12-1为跨膜蛋白.此研究结果将为解析PAE在茶树叶片氟富集和解毒过程中的功能奠定基础.

分类号: S571.1

  • 相关文献

[1]紫娟茶树miR828a靶基因WER的克隆及生物信息学分析. 刘悦,曲浩,尚卫琼,孙云南,田易萍,仝佳音,陈林波. 2020

[2]小麦NPR1基因家族鉴定及其表达分析. 李雅倩,王林,宋婧含,牛红莉,朱光,高春保,方正武,刘易科. 2021

[3]稻纵卷叶螟几丁质合成酶及合成通路相关酶基因的鉴定及表达分析. 余海中,黄克慧,汪婉玲,刘明辉,杨鑫,张彦,徐家萍. 2015

[4]贵州地方茶树品种资源的鉴定与利用. 鄢东海,刘声传,魏杰,刘红梅,罗显扬,陈元安. 2012

[5]福建10个茶树杂交创新种质初步鉴定. 王让剑,孔祥瑞,杨军. 2014

[6]湘西武陵山区29个优良单株的鉴定与评价. 刘振,杨培迪,赵洋,成杨,杨阳. 2017

[7]茶树倍性育种研究进展. 翟秀明,唐敏,罗红玉,邬秀宏,侯渝嘉. 2018

[8]我国代表性茶树种质嘌呤生物碱的鉴定. 金基强,周晨阳,马春雷,姚明哲,马建强,陈亮. 2014

[9]山东省茶树冰核细菌的鉴定. 黄晓琴,束怀瑞,刘会香,张丽霞,丁爱云,陈宗懋. 2010

[10]优质红碎茶资源的鉴定与筛选. 王新超,许玫,陈亮,杨亚军,姚明哲,虞富莲,王平盛. 2005

[11]茶树多倍体育种研究进展与远景综述. 刘青,林开勤,魏杰,陈文军,陈正武. 2023

[12]抗茶树冰核细菌内生菌的筛选及鉴定. 黄晓琴,张丽霞,刘会香,陈宗懋,李多川. 2015

[13]甘蔗核苷二磷酸激酶(NDPK1)基因克隆及表达分析. 李杨瑞,杨丽涛. 2012

[14]花生谷氨酸脱氢酶基因AhGDH1的克隆与生物信息学分析. 陈湘瑜,徐日荣,林栩松,唐兆秀. 2016

[15]灰毡毛忍冬MADS-box基因家族AGL15基因的克隆、生物信息学和表达分析. 蔡嘉洛,朱贻霖,陈林,樊悦,刘峰,张亚丽,欧阳琳,刘湘丹. 2016

[16]柞蚕腺苷酸转移酶基因的克隆与序列分析. 李玉萍,王欢,武松,夏润玺,刘彦群,秦利,李喜升,姜德富. 2009

[17]大豆FLAs蛋白理化性质和结构特征的生物信息学分析. 吴小明,胡颖. 2017

[18]栽培种花生FAE1基因的克隆和序列分析. 张欣,孙全喜,吴琪,王秀贞,胡东青,唐月异,王志伟,宋国生,徐建志,殷冬梅,王传堂. 2018

[19]高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒JL株Nsp10基因生物信息学分析. 周思旋,徐健,周碧君,王开功. 2012

[20]枣树抗坏血酸过氧化物酶基因ZjAPX生物信息学分析及植物表达载体的构建. 郝子琪,许洪仙,孟玉平,曹冬梅,曹秋芬. 2011

作者其他论文 更多>>