Maize 6H-60K芯片在玉米实质性派生品种鉴定中的应用分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 田红丽

作者： 田红丽;张如养;范亚明;杨扬;张云龙;易红梅;邢锦丰;王凤格;赵久然

作者机构：

关键词： 玉米;实质性派生品种;分子鉴定;Maize 6H-60K芯片;高密度SNP位点集合

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2023 年 49 卷 011 期

页码： 2876-2885

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 玉米实质性派生品种鉴定已成为当前种业知识产权保护的热点之一.为加快其精准高效分子鉴定技术的建立,本文利用多种类型派生品种为研究材料:京 2416 与京 2416C(两者为遗传背景高度相近的两个自交系),京 724与京 72464(两者为遗传背景相近的两个自交系),以及由京 724 与京 72464 两者构建的 893 个DH系遗传群体等.研究分析了Maize 6H-60K芯片(包含 61,214 个SNP位点集合)应用于玉米派生品种鉴定的潜力.结果显示:(1)京 2416与京 2416C间存在 829 个SNP位点差异,GS值(遗传相似度)为 98.7%,56.7%的差异位点集中分布在 5 号染色体长度约 39 Mb区域内.(2)京 724 与京 72464 之间差异位点数目为 4912 个,GS值为 90.1%,44.8%的差异位点集中分布在3 号染色体上.(3)893 个DH系与 2 个亲本京 724 及京 72464 之间的GS值分布均呈现连续性,其中与京 724 之间的GS值范围 88.0%~97.0%,平均值为 92.6%;与京 72464 之间的GS值范围 88.3%~98.6%,平均值为 94.5%.(4)893 个DH系进行两两成对比较,共比较 398,278 对,所有DH系之间均有明确的SNP位点差异;GS值最小为 87.5%,最大为 99.9%,平均值为 94.3%.结果表明Maize 6H-60K包含的SNP位点集能够精准评估派生、近似或极近似自交系及DH系的遗传背景,将所有材料一一鉴别明确区分开来,并具有进一步锁定与派生性状连锁标记的潜力.建议亟需基于Maize 6H-60K SNP位点集合,利用高效芯片、靶向测序等平台建立玉米实质性派生品种分子鉴定技术规程,为玉米品种知识产权保护、品种创新等提供技术支撑.

分类号： S513

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