苹果全基因组SBP-box基因家族分析及代表成员的分子克隆

文献类型: 中文期刊

第一作者: 张晓辉

作者: 张晓辉;魏小春;李锡香;孙玉燕;王冠;常兆晶;刘冠群;邱杨;宋江萍

作者机构:

关键词: 苹果;SBP-box家族;分子进化;基因克隆

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2014 年 41 卷 02 期

页码: 215-226

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 从金冠苹果基因组中鉴定出33个SBP-box家族基因,其中20个为miR156的靶基因。通过进化分析,对该家族成员进行了系统分类和功能预测。大部分预测的基因在富士苹果基因组中存在并表达,并且发现可变剪切在该家族基因中高频出现。在富士苹果中克隆了4个代表性成员基因,即MdSPL2、MdSPL11、MdSPL13和MdSPL33;与金冠相比,MdSPL33是一个缺失第2和3外显子的剪切本,并具有2个单碱基变异;MdSPL11和MdSPL13分别存在4个和2个单碱基变异,造成3个和1个氨基酸改变。

分类号: S661.1

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