非洲猪瘟病毒MGF505-5R基因分子特征及蛋白表达载体构建
文献类型: 中文期刊
第一作者: 沈兆基
作者: 沈兆基;谢春嫡;沙嘎那日·吉日木图;郭肖蓉;周荣;李奎
作者机构:
关键词: 猪;非洲猪瘟病毒;蛋白结构;真核表达载体
期刊名称: 农业生物技术学报
ISSN: 1674-7968
年卷期: 2023 年 005 期
页码: 1100-1110
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 非洲猪瘟(African swine fever, ASF)是一种对猪(Sus scrofa)具有毁灭性的疾病,通常引发出血热,对养猪业危害巨大。多基因家族(multigene families, MGF) 505-5R位于非洲猪瘟病毒(African swine fever virus, ASFV)基因组右侧可变区域(the right variable region, RVR),能够影响病毒的毒力。本研究旨在分析MGF505-5R基因和蛋白的分子特征,构建MGF505-5R基因真核表达载体。根据ASFV参考基因组(GenBank No. MK128995.1)提取MGF505-5R基因序列进行生物信息学分析,并合成MGF505-5R基因片段。通过同源重组的方式将MGF505-5R基因连接至pRK5M-C-2×Strep载体。经PCR和测序鉴定后,将重组质粒pRK5M-C-2×Strep-MGF505-5R转染至猪小肠上皮细胞系(porcine intestinal columnar epithelial cells, IPEC-J2)中,通过免疫荧光和Western blot检测MGF505-5R的基因表达效果。通过qPCR检测过表达p RK5M-C-2×Strep-MGF505-5R的IPEC-J2细胞中外切体(exosome) 8个亚基、Mtr4外切体RNA解旋酶(Mtr4 exosome RNA helicase, MTREX)、末端核苷酸转移酶4A (terminal nucleotidyltransferase 4A,TENT4A)、锌指DHHC型棕榈酰转移酶16 (zinc finger DHHC-type palmitoyltransferase 16, ZDHHC16)基因的表达。生物信息学分析结果表明,MGF505-5R基因在系统发育树中分为3个分支,MGF505-5R蛋白在20、105和485位氨基酸存在正向选择。MGF505-5R蛋白的二级结构与三级结构相符,正选择位点均位于无规则卷曲上。PCR结果显示MGF505-5R基因片段成功连接至pRK5M-C-2×Strep载体中。免疫荧光和Western blot检测结果显示,MGF505-5R蛋白能够在猪IPEC-J2细胞中表达。qPCR结果显示,过表达pRK5M-C-2×Strep-MGF505-5R的IPEC-J2细胞中外切体组分(exosome component, EXOSC) 1、EXOSC2、EXOSC3、EXOSC4、EXOSC5、EXOSC7、EXOSC8、EXOSC10、TENT4A和ZDHHC16的表达量极显著降低(P<0.01);MTREX的表达量无显著变化。本研究对MGF505-5R分子特征的分析,为该基因的进化研究提供基础;构建MGF505-5R在猪IPEC-J2细胞的表达载体,为ASFV与宿主之间的蛋白质相互作用研究提供有效的工具和实验素材。
分类号: S852.651
- 相关文献
[1]猪TLR5基因定点突变表达载体构建. 李海涛,陈月婵,牛艳春,李朋,刘娣,杨秀芹. 2012
[2]猪miRNA-101真核表达载体的构建及定点突变. 张姣,邵思宇,李利族,汪亮,刘娣,杨秀芹. 2015
[3]猪Sar1b基因真核表达载体构建及鉴定. 王学敏,李碧侠,任守文. 2007
[4]猪APOBEC3F基因真核表达载体的构建及其在MARC145细胞中的表达定位. 孟春花,王春玲,李静心,李隐侠,朱前明,曹少先. 2015
[5]猪Sarlb基因真核表达载体构建及鉴定. 王学敏,李碧侠,任守文. 2007
[6]柞蚕腺苷酸转移酶基因的克隆与序列分析. 李玉萍,王欢,武松,夏润玺,刘彦群,秦利,李喜升,姜德富. 2009
[7]剂量率对辐照牛血清蛋白生化特性和结构的影响. 耿胜荣,鉏晓艳,李新,白婵,李海蓝,叶丽秀,廖涛. 2017
[8]垂穗披碱草MADS-box基因WM8克隆及分析. 张妙青,张吉宇,刘志鹏,王彦荣,张磊. 2012
[9]秘鲁鱿鱼肌原纤维蛋白凝胶的构效关系研究. 林伟伟,励建荣,潘伟春,傅玉颖,李昂. 2017
[10]昆虫嗅觉相关可溶性蛋白的研究进展. 张玉,杨斌,王桂荣. 2019
[11]中国部分地区对虾白斑综合征病毒胶原蛋白基因缺失变异分析. 秦梦雪,刘庆慧,万晓媛,黄捷. 2017
[12]山羊紧密连接相关蛋白ZO-1序列的生物信息学分析. 王梦雅,赵学亮,徐明,李洋,宋利文,高峰,胡红莲,高民. 2018
[13]环糊精水解酶cds1-3底物通道氨基酸的定点突变研究. 汤宏赤,莫莉,闭海,林丽华,郭媛,庞浩. 2019
[14]改性处理对猪肌原纤维蛋白结构及凝胶特性的影响. 姜国川,王丽岩,刘亚春,孙洪蕊,张佳霖,刘学军,闫晓慧. 2019
[15]生长素反应因子ZmARF1的表达分析及互作网络探究. 孙建军,郭玉玺,王瑞,王德新,郭子宁,帖奇,鲁晓民. 2020
[16]小菜蛾腺苷受体基因PxAdoR克隆及杀虫靶标作用. 方鸣,柴一秋,陈官菊,章金明,吕要斌,黄勃. 2016
[17]桔黄赛多孢霉外泌弹性蛋白酶的生化特性. 彭元怀,葛歆,叶剑芝,金蓓,韩志萍. 2023
[18]牛GDF8基因编码蛋白结构和功能预测. 赵拴平,金海,徐磊,贾玉堂. 2023
[19]水貂AANAT基因克隆及生物信息学分析. 范冰峰,李文,刘理想,赵向远,邵静,林乐丰,孙慧敏,张旭林,许保增. 2023
[20]奶牛精子变形期间Pld6基因表达及蛋白序列分析. 李小俊,李欣,陈晓丽,赵毅强,路永强,王栋. 2018
作者其他论文 更多>>
-
内质网应激对骨骼肌细胞影响的研究进展
作者:刘颖;石建凯;郭肖蓉;林晓;周荣
关键词:骨骼肌细胞;内质网应激;未折叠蛋白反应;自噬;凋亡;胰岛素抵抗
-
桑树新品种‘皖桑3号’
作者:李瑞雪;朱克旭;苏雪强;周荣;许萃敏;汪泰初
关键词:桑树;品种
-
桑树在生态环境修复中的应用前景探讨
作者:许萃敏;李瑞雪;周荣;苏雪强;汪泰初
关键词:桑树;土壤修复;水土保持;防风固沙;大气净化;消落带修复;石漠化治理
-
非洲猪瘟病毒O174L蛋白的真核表达载体构建及分子特征分析
作者:沙嘎那日·吉日木图;林晓;沈兆基;郭肖蓉;李奎;贾红;周荣
关键词:非洲猪瘟病毒;O174L基因;真核表达;分子特征
-
球形赖氨酸芽孢杆菌WH07对潜育化水稻土的改良效果和土壤微生态的影响
作者:王麒;李奎;彭成林;罗治华;陈涛;易菊平;龚艳;胡洪涛
关键词:潜育化稻田;土壤改良;球形赖氨酸芽孢杆菌;还原性物质;氧化还原电位;氮循环功能基因;土壤微生态
-
马铃薯干替代玉米对生长育肥猪生长性能、肉质性状和血常规指标的影响
作者:颜港;邢天琦;王钰滨;江山;张帅;许迪;张坤;王梦影;梁晶;兰干球;李奎;黄三文
关键词:马铃薯干;胴体性状;生长性能;肉质性状;血常规指标
-
安徽省蚕桑产业发展现状及对策
作者:许萃敏;朱克旭;李瑞雪;苏雪强;周荣;汪泰初
关键词:蚕桑产业;发展现状;主要问题;发展对策;规模化;多元化;融合发展