猪繁殖与呼吸综合征病毒Shanxi-6株全基因序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 韩一超

作者： 韩一超;刘文俊;姚敬明;吴忻;王娟萍;武守艳;陈剑波;孟帆;郭慧慧;杨丽华;雷宇平;樊振华

作者机构：

关键词： 猪繁殖与呼吸综合征病毒;基因组;序列分析

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2014 年 29 卷 02 期

页码： 65-68

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用RT-PCR方法,分段扩增出猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)Shanxi-6株15个基因片段,并将这15个片段分别连接到pMD18-T载体上进行克隆测序、拼接后,得到PRRSV Shanxi-6株全基因组长15 320 bp(不包含PolyA尾),包含9个开放阅读框,5'UTR长189 bp,3'UTR长150 bp。基因组序列分析结果表明,Shanxi-6株与欧洲型代表毒株LV的核苷酸序列同源性为54.35%,与美洲型代表毒株VR-2332的核苷酸序列同源性为88.80%,与HPPRRSV毒株(JXA1、HUN4、HuN、HUB1)亲缘关系最近,核苷酸序列同源性高达97.44%~97.74%,且在非结构蛋白Nsp2上有30个氨基酸的缺失。

分类号： S852.65

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