蒙古冰草ERF转录因子生物信息学及其表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴婧

作者： 吴婧;范菠菠;张学峰;宋金微;房永雨;于卓;闫秀秀;赵彦;马艳红

作者机构：

关键词： 蒙古冰草;ERF转录因子;抗旱;生物信息学分析

期刊名称： 草地学报

ISSN： 1007-0435

年卷期： 2022 年 011 期

页码： 2910-2921

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： ERF（Ethylene responsive factor）家族是植物中一种重要的转录因子，参与植物生长发育和逆境胁迫响应。为筛选蒙古冰草（Agropyron mongolicum Keng）抗旱相关的ERF转录因子，本研究利用生物信息学方法对其理化性质、亚细胞定位、保守基序、进化关系及其二、三级结构进行分析，同时对不同干旱处理下的ERF基因进行表达分析。结果显示：筛选得到18个具有ERF结构特征的蒙古冰草ERF转录因子，蛋白大小在70～404 aa之间，分子质量在7 447.54～43 654.9之间，理论等电点（PI）在4.53～11.10之间，其中有2个疏水性蛋白，其余均为亲水性蛋白，大部分定位于细胞核。ERF转录因子的二、三级结构以无规则卷曲为主，推测motif1,motif2,motif3为保守基序。进化关系比对发现AmERF053,AmERF1B,AmERF4-1,AmERF4-2与已知具有抗旱功能的蛋白具有较高同源性，且在干旱处理的蒙古冰草中显著差异表达。

分类号： S543.9

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