蒙古冰草脱水素基因生物信息学识别及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 翟永青

作者： 翟永青;马艳红;范菠菠;房永雨;张学峰;于卓;李坤;吴婧;闫秀秀;赵彦

作者机构：

关键词： 蒙古冰草;脱水素基因;生物信息学分析;干旱胁迫

期刊名称： 草地学报

ISSN： 1007-0435

年卷期： 2024 年 003 期

页码： 684-692

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为挖掘蒙古冰草（Agropyron mongolicum Keng）干旱胁迫响应的脱水素基因，本研究在转录组测序数据的基础上，利用生物信息学方法对蒙古冰草脱水素基因进行理化性质、亚细胞定位、保守基序、系统发育进化分析，对不同干旱处理的脱水素基因进行差异表达分析。结果表明：共筛选到6个具有脱水素蛋白保守结构域的蒙古冰草脱水素基因，蛋白大小在81～275个氨基酸残基之间；分子量在0.83～2.75 kD之间；理论等电点在5.14～10.00之间；6个脱水素基因预测均位于细胞核；AmDHNs基因编码的蛋白均包括motif1和motif2;系统进化树发现DN14936＿c0＿g6,DN18948＿c1＿g4与已知具有抗旱功能的基因具有较高同源性。qRT-PCR分析与对照（CK）相比5个基因在干旱处理下显著差异表达，1个基因的表达量差异不显著，综合转录组测序数据和qRT-PCR分析表明6个基因的表达量随干旱处理时间延长总体呈上升趋势。本研究可为蒙古冰草抗旱相关脱水素基因的生物学功能验证提供理论基础。

分类号： S543.9

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