基于F2和RIL群体鉴定棉花抗黄萎病主效QTL

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵云雷

作者： 赵云雷;王文菊;陈伟;王海红;朱喜霞;杨继华;鲁宁宁;赵佩;桑晓慧;崔艳利;敦磊;王红梅

作者机构：

关键词： 棉花;黄萎病;QTL定位;重组自交系;基因挖掘

期刊名称： 棉花学报

ISSN：

年卷期： 2023 年 002 期

页码： 101-116

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】通过对棉花抗黄萎病性状进行数量性状位点（quantitative trait locus,QTL）定位，鉴定可以应用于育种实践的能稳定检测到的主效QTL，为棉花抗黄萎病遗传改良奠定分子基础。【方法】以抗黄萎病品种中植棉2号和感黄萎病品种冀棉11号为亲本杂交的F2群体和重组自交系（recombinant inbred lines,RIL）群体作为作图群体，在对2个群体进行多环境黄萎病抗性鉴定和简单重复序列（simple sequence repeat,SSR）分子标记检测的基础上进行遗传连锁图谱构建，利用完备区间作图法进行QTL定位，并对获得的主效QTL置信区间进行候选基因挖掘。【结果】在F2:3家系和RIL群体中共检测到7个抗黄萎病QTL，能够在多个环境条件下重复检测到的QTL有4个，包括q VW-D05-1、qVW-D05-2、q VW-D05-4和qVW-D05-5。共线性分析表明上述4个QTL集中分布于D05染色体上2 293 776～3 205 058 bp和62 407 897～62 582 344 bp 2个区域。4个抗性QTL的聚合可以显著降低棉花黄萎病病情指数。qVW-D05-1在多个环境中的表型变异解释率均在10%以上，为抗黄萎病主效QTL。对qVW-D05-1置信区间内的基因进行了功能注释、黄萎病菌诱导后的表达模式分析和单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）变异分析，初步推测Ghir＿D05G038990、Ghir＿D05G039060、Ghir＿D05G039100、Ghir＿D05G039110和Ghir＿D05G039130为可能控制棉花黄萎病抗性的候选基因。【结论】在不同环境中共检测到7个抗黄萎病QTL，其中4个QTL被重复检测到，在主效QTL q VW-D05-1区间内筛选获得5个棉花抗黄萎病候选基因。这些稳定的抗黄萎病相关的QTL及其候选基因可应用于棉花抗黄萎病性状的分子标记辅助选择育种。

分类号： S435.621

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