葡萄扇叶病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立及应用

文献类型: 中文期刊

第一作者: 周俊

作者: 周俊;范旭东;董雅凤;张尊平;胡国君;任芳;李正男

作者机构:

关键词: 葡萄;葡萄扇叶病毒;实时荧光定量RT-PCR;病毒浓度

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2016 年 43 卷 03 期

页码: 538-548

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 根据葡萄扇叶病毒(Grapevine fanleaf virus,GFLV)RNA2序列设计4对特异性引物,通过引物筛选、体系优化,建立了以FL-HP1-F/R为引物的GFLV的SYBR GreenⅠ实时荧光定量RT-PCR方法。该方法标准曲线循环阈值与模板浓度呈良好的线性关系,扩增效率为100%,相关性系数为0.998,灵敏性分别是常规RT-PCR和巢式RT-PCR的100倍和10倍。重复性试验表明组内和组间变异系数均小于2.59%,显示该方法具有较好的检测稳定性。内参基因的稳定性测试结果表明葡萄EF1和GAPDH基因具有较好的试验稳定性。利用建立的荧光定量方法测定12个葡萄样品中GFLV含量,并检测58个葡萄样品,结果表明不同葡萄样品中GFLV含量差异较大,最高含量是最低含量的81 245.5倍,与ELISA和巢式RT-PCR相比,实时荧光定量方法能检测出更多的GFLV分离物。

分类号: S436.631.19

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