甘蓝型油菜HD-ZIP基因家族的鉴定和表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 昝领兄

作者： 昝领兄;李开祥;贾永鹏;杜德志

作者机构：

关键词： 甘蓝型油菜;HD-ZIP蛋白基因家族;差异表达

期刊名称： 西北农业学报

ISSN： 1004-1389

年卷期： 2020 年 29 卷 009 期

页码： 1351-1363

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为揭示HD-ZIP蛋白家族成员在甘蓝型油菜全基因组中的分布及相关特征,通过生物信息学方法共鉴定出74个HD-ZIP转录因子,分别被定位到甘蓝型油菜的19条染色体和8条随机序列;这74个HD-ZIP蛋白都含有高度保守的HD-ZIP结构域;系统发育进化树将该家族成员聚为4大类;共线性分析发现大部分基因不仅在A和C染色体组间存在共线性,而且在各自染色体组内也存在串联重复事件;基因表达分析发现,大部分HD-ZIP家族基因在根和叶中均有表达,并且在根中表达的基因多于叶片,受到盐胁迫处理时,大部分基因表达量会增加.初步明确了甘蓝型油菜HD-ZIP家族成员结构特点和相关功能,为进一步研究甘蓝型油菜HD-ZIP蛋白家族基因的生物学功能奠定了基础,为油菜抗性育种工作提供科学依据.

分类号： S565.4

  • 相关文献

[1]甘蓝型油菜双主茎材料苗期抗旱相关基因的cDNA-AFLP差异显示. 俎峰,罗延青,赵凯琴,马芳,董云松,符明联,陈苇,王敬乔,李根泽,李劲峰. 2011

[2]甘蓝型油菜NCa细胞质雄性不育系统花药败育前期的基因差异表达. 危文亮,王汉中,刘贵华. 2007

[3]甘蓝型油菜双隐性细胞核雄性不育的细胞学及育性相关基因的差异表达研究. 樊云芳,胡胜武,董彩华,郭学兰,刘胜毅. 2006

[4]赤霉素诱导甘蔗节间伸长基因的cDNA-SCoT差异表达分析. 吴建明,李杨瑞,王爱勤,杨柳,杨丽涛. 2010

[5]斑点叉尾(鮰)血浆铜蓝蛋白的全长cDNA克隆及表达特征分析. 孟艳青,党广成,刘洋,王启龙,沙珍霞. 2013

[6]芸苔链格孢菌与白菜互作基因表达谱芯片分析. 刘影,徐文静,杜茜,杨信东,李启云. 2010

[7]高羊茅春化基因FaVRN1亚细胞定位与差异表达分析. 王小利,吴佳海,刘晓霞,舒健虹,王舒颖. 2011

[8]cDNA-AFLP和cDNA-SRAP技术在植物基因差异表达上的应用及其分析比较. 李杨瑞,杨柳,王爱勤,杨丽涛,熊发前,甘崇昆. 2009

[9]青海高原耐旱蚕豆品种青海13号响应干旱胁迫蛋白质组学分析. 李萍,侯万伟,刘玉皎. 2019

[10]高羊茅光周期调控基因FaCONSTANS亚细胞定位与差异表达分析. 王小利,吴佳海,刘晓霞,王舒颖,舒健虹. 2011

[11]骨形态发生蛋白IB型受体(BMPR-IB)基因在蒙古羊卵巢和子宫组织中的表达分析. 何小龙,刘永斌,王峰,田春英,达赖,荣威恒. 2010

[12]甘蔗cDNA-SCoT差异显示分析PCR反应体系建立、优化及应用. 李杨瑞,杨丽涛,吴建明. 2013

[13]水稻分蘖期强势和弱势F_1基因表达差异分析. 戴正元,陈建民,肖宁,周长海. 2010

[14]6个wnt基因家族基因在细粒棘球绦虫原头节和成虫的差异表达分析. 王正荣,张艳艳,薄新文,徐雪平,徐春生. 2016

[15]奶牛初乳与常乳乳蛋白变化的比较蛋白质组学研究. 杨永新,王加启,卜登攀,张乐颖,李珊珊,张春林,周凌云. 2010

[16]鸭IGF-IR基因部分序列克隆、鉴定及在胚胎期胸肌组织中的差异表达分析. 束婧婷,单艳菊,胡艳,宋迟,宋卫涛,朱文奇,徐文娟,陈文峰,李慧芳. 2013

[17]高邮鸭和金定鸭发育早期骨骼肌发育及胰岛素样生长因子1受体基因(IGF-IR)表达分析. 朱春红,徐文娟,胡艳,朱文奇,宋迟,陈文峰,李慧芳. 2013

[18]利用cDNA-SRAP分析赤霉素诱导甘蔗节间伸长的差异表达. 李杨瑞,王爱勤,杨柳,杨丽涛. 2010

[19]PGC-1α基因在两个品种鸡两种表型肌肉中的差异表达. 单艳菊,束婧婷,章明,姬改革,屠云洁,张迪,盛中伟,范建华,邹剑敏. 2016

[20]不同鸭种胚胎期和岀雏早期肌肉组织中IGF-Ⅰ基因mRNA的差异表达分析. 单艳菊,顾华兵,宋卫涛,束婧婷,朱文奇,胡艳,李慧芳. 2013

作者其他论文 更多>>

微信小程序