当阳鱼腥草花叶病病原分子鉴定
文献类型: 中文期刊
第一作者: 周洁
作者: 周洁;吴方华;燕飞;齐传东;郭凤领;吴金平
作者机构:
关键词: 鱼腥草;黄瓜花叶病毒;sRNA深度测序;RT-PCR
期刊名称: 中国瓜菜
ISSN: 1673-2871
年卷期: 2024 年 37 卷 009 期
页码: 54-58
摘要: 明确当阳鱼腥草花叶病致病菌种类,为当阳鱼腥草花叶病的田间防治提供依据。采集鱼腥草花叶叶片提取当阳鱼腥草典型病样的总RNA,利用sRNA深度测序,结合生物信息学分析初步确定病原菌,利用该病毒外壳蛋白(CP)特异性引物进行RT-PCR检测,所得序列进行BLAST比对和系统进化树构建,以进一步确定病原菌种类。利用sRNA深度测序和生物信息学初步确定鱼腥草花叶病致病菌为黄瓜花叶病毒(CMV),特异性引物扩增得到878 bp特异性条带,经BLAST比对发现其与已发表的CMV序列高度同源,相似性最高达97.84%。通过CMV病毒CP基因的核苷酸序列构建系统进化树可得鱼腥草花叶病病毒属于CMV亚组Ⅱ。引起鱼腥草花叶病的病原属于黄瓜花叶病毒Ⅱ亚组,研究结果为鱼腥草花叶病防治提供了理论基础。
分类号: S435.672
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