克隆文库分析红树林土壤中放线菌的多样性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 谢晴宜

作者： 谢晴宜;屈直;马海霞;洪葵

作者机构：

关键词： 红树林土壤;克隆文库;放线菌;多样性.

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2012 年 33 卷 08 期

页码： 1466-1470

收录情况： CSCD

摘要： 直接提取8个红树林土壤的总DNA,用放线菌门的特异性PCR引物进行扩增,通过构建16S rRNA文库,测序及系统发育分析,获取新颖放线菌菌株。结果发现,有酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)(30.2%)、放线菌亚纲(Actinobacteridae)(68.0%)、红蝽菌亚纲(Coriobacteridae)(1.1%)和去腈基菌亚纲(Nitriliruptoridae)(0.7%)成员,没有红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae)成员。仙农指数和Chao1物种多样性指数(Schao1)表明,红树林土壤样品中含有丰富的放线菌多样性。以16S rDNA基因的相似率≥97%作为临界点,45.1%可能代表新候选种(candidate species)(未培养、分离)。本研究为进一步获取新颖的红树林放线菌资源提供了基础。

分类号： S714

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