甜菜铵转运蛋白BvAMT1-3基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 魏多

作者： 魏多;刘铭曦;高卓;李佳佳;刘大丽;马龙彪

作者机构：

关键词： 甜菜;铵转运蛋白;基因;克隆;生物信息学

期刊名称： 中国糖料

ISSN： 1007-2624

年卷期： 2021 年 004 期

页码： 1-8

摘要： 在植物体内,由铵转运蛋白（Ammonium transporters, AMTs）介导植株对铵态氮的吸收和转运。氮素在甜菜糖代谢的过程中起着重要作用,对甜菜AMTs蛋白的功能特性及调控机制进行生物信息学分析对于解析甜菜AMT基因家族的分子功能具有重要意义。本研究通过RT-PCR的方法,在甜菜体内克隆获得了Beta vulgaris ammonium transporter 1-3（BvAMT1-3）基因的全长序列。生物信息学分析结果显示该基因大小为1 388 bp,编码462个氨基酸,分子量约为49.729 kDa,亚细胞定位分析其位于内质网膜结构上的可能性较大。系统进化分析显示5个甜菜AMT蛋白序列可分成2个亚族,AMT3亚族仅有1个成员,其余为AMT1亚族成员,同时甜菜BvAMT1-3蛋白与菠菜SoAMT1-3蛋白的亲缘关系最近。5个AMT基因家族成员均由α-螺旋、β-折叠、扩展链以及无规则卷曲4种形式组成。BvAMTs基因家族间的等电点、亲水性、相对分子质量等理化性质存在差异。此外,BvAMT1-3基因的启动子区检测到与植物逆境胁迫、光反应和生长发育相关的顺式作用元件。研究结果可为后续甜菜BvAMT1-3基因在氮胁迫逆境下分子机制的研究提供一定的科学依据。

分类号： S566.3

  • 相关文献

[1]镉逆境胁迫下甜菜谷胱甘肽合成酶(BvGS)基因的克隆. 刘大丽,马龙彪,郭爱英,杨洪,鲁振强. 2017

[2]玉米ZmRab6A基因的克隆与生物信息学分析. 时丕彪,胡凤琴,顾小兵,吕远大. 2020

[3]甜菜BTB蛋白家族的挖掘与生物信息学分析. 刘宇,杨巧,王晓丹,赵春雷,王希,李彦丽,贾海伦,丁广洲,陈丽. 2021

[4]甜菜SBPase基因的遗传转化. 韩平安,孙瑞芬,唐宽刚,常悦,王良,金晓蕾,梁亚晖,李晓东,吴新荣. 2022

[5]浅谈生物及物理技术在甜菜育种上的应用. 朱国民,张宇航,周玉萍,杨贵春. 2009

[6]甜菜基因BvPCNA-like的克隆及结构分析. 刘昕彤,申子萌,张琦,张西宁,陶艳昵,李志烨,王希,赵春雷. 2023

[7]甘薯等10种作物基因的生物信息学分析. 杨冬静,徐振,张成玲,孙厚俊,赵永强,谢逸萍. 2017

[8]不同施氮水平下秋马铃薯的生长以及StNR和StAT的表达. 胡新喜,冯艳青,雷艳,刘明月,熊兴耀. 2015

[9]甜菜蔗糖磷酸合酶基因(BvSPS1)的克隆、表达及酶活性分析. 李建平,危晓薇,陈勋基,郝晓燕,葛峰,足木热木,黄全生,罗淑萍. 2010

[10]甜菜NADH-NR gDNA全长序列的克隆及酶切鉴定. 丁广洲,侯静,马凤鸣,陈丽,陈连江. 2012

[11]甜菜蔗糖磷酸合成酶基因的克隆及序列分析. 刘大丽,马龙彪,郝慧. 2010

[12]木薯Actin基因片段的克隆及序列分析. 罗兴录. 2011

[13]龙眼转醛醇酶基因的克隆与原核表达. 游向荣,许鸿川,梁文裕,郑少泉,陈伟. 2009

[14]苹果细胞质型苹果酸脱氢酶基因克隆、表达及酶活性分析. 姚玉新,郝玉金,李明,庞明利,刘志,翟衡. 2008

[15]低温胁迫下龙眼碳酸酐酶基因(CA)的克隆与表达分析. 何新华,罗聪,杨丽涛,黄杏,胡颖. 2012

[16]小麦抽穗期基因研究进展. 董春林,张明义,张晓军. 2010

[17]扁桃SLF基因和S-RNase基因的克隆及表达分析. 郭振宇,常凤启,谢华,徐勇,马荣才. 2006

[18]荔枝果实内切-1,4-β-葡聚糖酶基因(EG)的克隆及其表达分析. 吴富旺,邝健飞,陆旺金,刘洪见,陈建业. 2009

[19]转座子标签法克隆水稻基因前景. 朱正歌,孙宗修. 2001

[20]6株猪圆环病毒2型全基因组克隆和序列分析. 董亚青,朱爱萍,郭广富,朱文斗,於敏,曹军平. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序