玉足海参变态附着阶段转录组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴晓鹏

作者： 吴晓鹏;黄敏伟;陈晓瑛;彭凯;赵吉臣;钟平;刘凤坤;张业辉;黄文

作者机构：

关键词： 玉足海参;转录组测序;差异基因;癌症途径

期刊名称： 南方水产科学

ISSN：

年卷期： 2023 年 006 期

页码： 84-96

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 海参幼苗发育需要经历耳状幼体、樽形幼体、五触手幼体及幼苗阶段，而从浮游幼体变态发育至附着幼苗阶段的高死亡率是热带海参繁育中的共性问题，目前有关热带海参变态发育的调控机制仍不清楚。以玉足海参（Holothuria leucospilota）为研究对象，采集小耳幼体（A）、中耳幼体（B）、大耳幼体（C）和樽形幼体（D） 4个时期样品进行高通量转录组测序分析，以探究其变态发育的分子机制。结果显示，共产生83.6 GB Raw reads，拼接获得93 528个Unigenes。对4个组测序文库的相邻组间（A＿vs＿B, B＿vs＿C, C＿vs＿D）进行两两比较，A＿vs＿B、B＿vs＿C和C＿vs＿D的差异表达基因数目分别为17 732、11 757和11 319个。GO功能富集显示，差异基因主要富集于分子功能、催化活性等与细胞成长相关的GO功能。此外对KEGG通路进行了分析，结果显示差异基因显著富集于PI3K-Akt、细胞周期、癌症途径等与细胞分化增殖、凋亡相关的信号通路中，其中在幼体由浮游的大耳状幼体变态至附着的樽形幼体过程中，癌症途径的富集频率显著上升，表明其在幼体生长发育模式转换上发挥了关键作用。筛选的差异表达基因及预测的功能信息可为热带海参生长发育调控机制研究、人工繁育及分子改良应用提供参考。

分类号： S968.9

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