鸡Wnt3a的SNPs筛选及其与皮肤毛囊密度性状关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 屠云洁

作者： 屠云洁;姬改革;章明;刘一帆;巨晓军;单艳菊;邹剑敏;李华;陈智武;束婧婷

作者机构：

关键词： 鸡;Wnt3a;皮肤毛囊;SNP位点;连锁不平衡

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2022 年 55 卷 023 期

页码： 4769-4780

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]Wnt信号通路在动物皮肤毛囊的发生发育中具有重要作用,前期研究结果表明Wnt3a可能是影响鸡皮肤毛囊密度性状的重要候选基因.为进一步验证Wnt3a在皮肤毛囊生长发育中的作用,研究以金陵花鸡为研究对象,筛选Wnt3a SNPs,并分析其与毛囊密度性状的相关性,以期找到对皮肤毛囊密度有显著影响的分子标记,为培育屠体美观的屠宰型肉鸡的"分子编写育种"提供参考.[方法]采用PCR扩增直接测序法对Wnt3a的SNPs位点进行筛查,分析单个SNP标记与皮肤毛囊密度性状的相关性.采用Haploview软件分析这些SNP位点的连锁不平衡(LD)程度,并分析不同单倍型组合与毛囊密度性状的相关性.[结果]共发现14个SNP位点,在第2外显子发现1个SNP位点(SNP1),为同义突变;第2内含子发现4个突变位点(SNP2—SNP5),在第3内含子发现9个SNP位点(SNP6—SNP14).卡方检验表明,第2外显子的1个突变位点(SNP1)和第2内含子的3个突变位点(SNP3—SNP5)的3个位点均处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05),第3内含子的9个SNPs(SNP6-SNP14)偏离哈代-温伯格平衡(P<0.05).SNP1—SNP5的He均小于0.50,PIC均小于0.25,这5个SNP位点遗传多样性较低.第3内含子的9个突变位点,SNP6、SNP7、SNP9位点PIC<0.25,其他6个突变位点0.25A)和SNP8(rs2555967G>A)位点与毛囊密度显著相关,8个SNPs(SNP6—SNP13)位点处于强连锁不平衡,母鸡H1H1单倍型毛囊密度最大.Wnt3a的SNP2和SNP8位点的单倍型组合H1H1(AGAA)、H1H2(AGAG)和SNP6—SNP13连锁产生的H1H1(AACCAATTTTAATTCC)单倍型组合与母鸡毛囊密度显著相关,可以为鸡毛囊密度"分子编写育种"提供重要遗传信息.

分类号： S831

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